More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1108 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  100 
 
 		 197 aa  401  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  48.67 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  46.67 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  50.35 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  52.17 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  48.37 
 
 		 187 aa  136  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  45.71 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  47.97 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  47.48 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  46.98 
 
 		 203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  43.56 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  43.56 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  43.56 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  43.29 
 
 		 161 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  40.61 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  42.47 
 
 		 157 aa  108  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  38.27 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  37.01 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  40 
 
 		 178 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  35.05 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  38.31 
 
 		 178 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  40.43 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  37.16 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  37.84 
 
 		 174 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  39.53 
 
 		 181 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  37.21 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  36.43 
 
 		 171 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  34.48 
 
 		 173 aa  91.3  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  39.84 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  37.4 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  37.4 
 
 		 187 aa  90.5  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  38.76 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  39.5 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  37.98 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  37.3 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  37.3 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  37.21 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  36.09 
 
 		 173 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  37.4 
 
 		 170 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  40 
 
 		 162 aa  85.9  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  39.58 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  34.64 
 
 		 174 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  44.35 
 
 		 173 aa  80.9  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  37.93 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  35.25 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  31.18 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  30.65 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  35.97 
 
 		 931 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  43.59 
 
 		 139 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  35.06 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  34.96 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  33.93 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  36.76 
 
 		 494 aa  75.5  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  32.3 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1585 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  32.43 
 
 		 346 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  33.91 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  32.86 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  33.86 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  30.11 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  28.75 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1402 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  28.77 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  37.88 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  30.07 
 
 		 490 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  33.54 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.85 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.61 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  28.74 
 
 		 855 aa  68.6  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.53 
 
 		 426 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  42.45 
 
 		 1387 aa  68.2  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.86 
 
 		 954 aa  67.8  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0582  ankyrin  31.29 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.53 
 
 		 891 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0197  ankyrin repeat-containing protein  31.51 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  31.79 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  26.67 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  38.18 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  29.05 
 
 		 762 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  27.4 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  29.01 
 
 		 870 aa  65.1  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  28.31 
 
 		 776 aa  64.7  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  28.1 
 
 		 1005 aa  65.1  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  34.62 
 
 		 541 aa  64.7  0.0000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  27.63 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  27.63 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  31.94 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  28.3 
 
 		 542 aa  64.3  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  31.97 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  38.05 
 
 		 125 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  28.27 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  36.79 
 
 		 130 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  30.88 
 
 		 2171 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2101  Ankyrin  35.2 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000501004 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  30.94 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  37.17 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1869  hypothetical protein  31.19 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00478712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  32.89 
 
 		 1061 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.09 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.959203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>