More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2070 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2070  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
618 aa  1251    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.360567  normal  0.0416579 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1822  molybdopterin oxidoreductase  77.83 
 
 
622 aa  997    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00253094  hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1026  molybdopterin oxidoreductase  76.7 
 
 
630 aa  978    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0299626 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0930  molybdopterin oxidoreductase  42.81 
 
 
580 aa  451  1e-125  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0423  anaerobic dehydrogenase  44.36 
 
 
583 aa  438  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1631  formate dehydrogenase  42.19 
 
 
647 aa  419  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0064  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  31.94 
 
 
635 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
703 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  29.44 
 
 
701 aa  230  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
666 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.81 
 
 
673 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 
684 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  29.83 
 
 
674 aa  225  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.88 
 
 
708 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  29.37 
 
 
693 aa  222  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
691 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.48 
 
 
708 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  29.28 
 
 
691 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 
734 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
691 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
691 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 
698 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.45 
 
 
698 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
692 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.21 
 
 
692 aa  216  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
695 aa  216  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  29.46 
 
 
692 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
698 aa  213  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 
727 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 
691 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 
720 aa  207  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 
692 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 
690 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 
688 aa  206  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
688 aa  205  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  27.75 
 
 
710 aa  204  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 
726 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
688 aa  203  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
691 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 
726 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 
712 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
694 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  27.8 
 
 
680 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
691 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
691 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 
705 aa  200  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 
703 aa  199  9e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
691 aa  199  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1215  Nitrate reductase  27.68 
 
 
643 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0607485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 
726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 
691 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  29.6 
 
 
688 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.32 
 
 
674 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.25 
 
 
679 aa  195  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 
709 aa  194  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.11 
 
 
703 aa  193  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
670 aa  193  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  26.09 
 
 
738 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1360  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 
703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
703 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  28.72 
 
 
697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1380  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
702 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2325  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 
708 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.84613  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4710  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 
703 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 
673 aa  185  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3550  Nitrate reductase  26.63 
 
 
669 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1091  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
712 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358526  hitchhiker  0.000876174 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1237  Nitrate reductase  26.32 
 
 
734 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0895339  hitchhiker  0.000112023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  25.82 
 
 
737 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4036  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
720 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.272117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  27.52 
 
 
676 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5740  putative dimethyl sulfoxide reductase(DMSO reductase)  25.43 
 
 
695 aa  181  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0281361  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3381  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 
707 aa  179  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3195  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 
637 aa  179  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 
728 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  25.51 
 
 
737 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
662 aa  178  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 
678 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.13 
 
 
759 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.13 
 
 
759 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.13 
 
 
759 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 
677 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
718 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 
662 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.13 
 
 
759 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0698  putative oxidoreductase, molybdopterin-binding  26.1 
 
 
708 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0707  oxidoreductase, molybdopterin-binding, putative  26.1 
 
 
708 aa  173  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18943  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2579  nitrate reductase  26.43 
 
 
706 aa  173  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 
671 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
718 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2119  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
689 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
732 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4922  molybdopterin oxidoreductase  27.37 
 
 
700 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400406  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0789  nitrate reductase  25.18 
 
 
710 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.130899  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1053  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
701 aa  164  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.62402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4362  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 
699 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481133  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.64 
 
 
671 aa  161  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>