55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1789 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 110 aa  231  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  89.09 
 
 		 110 aa  207  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  81.82 
 
 		 124 aa  199  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  80 
 
 		 110 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  55.75 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  47.75 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  46.49 
 
 		 110 aa  103  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  47.27 
 
 		 103 aa  103  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  46.36 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  46.36 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  46.36 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  43.64 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  46.85 
 
 		 105 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  43.52 
 
 		 103 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  39.09 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.18 
 
 		 103 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  40.37 
 
 		 104 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  39.33 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  42.2 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  46.15 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  34.82 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  36.84 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  39.78 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  40.91 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  36.28 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  36.36 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  35.4 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  35.19 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  35.14 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  36.11 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  35.14 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  36.04 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  33.87 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  33.33 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  32.17 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  42.86 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  29.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  42.11 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  40.62 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  30.28 
 
 		 112 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  44.83 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  48.28 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24922  predicted protein  31.82 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  51.35 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  41.82 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  30.36 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  35.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  45.95 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  32.05 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  29.82 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  36.84 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  47.22 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  43.24 
 
 		 173 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>