15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1177 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  100 
 
 		 89 aa  176  8e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  85.39 
 
 		 89 aa  157  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  85.39 
 
 		 89 aa  155  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  83.15 
 
 		 91 aa  153  8e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46.07 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  46.67 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  65.85 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  46.67 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.33 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  48.28 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0213  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  40.51 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  38.6 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  35.9 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 109 aa  42  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>