15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0787 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  100 
 
 		 88 aa  176  7e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46.07 
 
 		 89 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  46.07 
 
 		 89 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46.99 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  44.44 
 
 		 89 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0213  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  43.28 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  43.66 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  37.5 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  33.75 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46.77 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  42.86 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  33.75 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  44.07 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  41.82 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  38.6 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>