17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1669 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  100 
 
 		 102 aa  194  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  66.67 
 
 		 101 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  60.98 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  63.41 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  65.85 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  63.41 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0213  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  41.98 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  46.15 
 
 		 109 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  41.38 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  60 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  44.44 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  40.62 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  37.7 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  36.84 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  29.82 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  51.72 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>