47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0625 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 109 aa  223  9e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  44.64 
 
 		 114 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.54 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  40.74 
 
 		 115 aa  87.4  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  43.12 
 
 		 110 aa  87.4  5e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  41.51 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  43.12 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.91 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.82 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  42.2 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  39.45 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  39.45 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  37.61 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  39.45 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.53 
 
 		 104 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  40.71 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  35.78 
 
 		 105 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  34.58 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  34.58 
 
 		 102 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  32.41 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  36.7 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  42.73 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  41.86 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  31.78 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  30.56 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  34.07 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  30.91 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  42.62 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  31.43 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  30.91 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  31.67 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  29.73 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  30.91 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0213  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  40 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  27.27 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  28.44 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  28.18 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  34.48 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  24.35 
 
 		 111 aa  43.5  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  27.93 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  26.5 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  41.3 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  32.81 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  51.61 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>