46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1756 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 105 aa  214  4e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  39.64 
 
 		 115 aa  90.9  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  46.85 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  42.31 
 
 		 103 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  38.1 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  43.24 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  38.89 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  38.89 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  40.78 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  37.5 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.28 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  48.96 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  38.89 
 
 		 105 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  39.42 
 
 		 103 aa  84.3  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  43.24 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  39.45 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.23 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  39.42 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  40 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  35.78 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  39.05 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  37.25 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  37.25 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  36.27 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  36.89 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  32.71 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  37.93 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  32.08 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  32.35 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  32.41 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  34.91 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  35.19 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  31.25 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  31.13 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  26.89 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  32.08 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  29.09 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  32.46 
 
 		 123 aa  50.4  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  30.63 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04219  RNA polymerase III subunit C11, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06380)  30.19 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267157  normal  0.568074 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  28.45 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  27.78 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  46.34 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  32.88 
 
 		 304 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  42.86 
 
 		 294 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  40.74 
 
 		 173 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>