47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34016 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  100 
 
 		 120 aa  247  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  48.39 
 
 		 111 aa  120  8e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  47.46 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  45.83 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04219  RNA polymerase III subunit C11, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06380)  41.82 
 
 		 108 aa  87.8  4e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.267157  normal  0.568074 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  30.65 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  33.06 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  32.5 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  31.71 
 
 		 114 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  31.45 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  31.45 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  33.87 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  32.23 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  29.84 
 
 		 105 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  31.62 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  33.06 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  29.37 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  29.41 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  27.73 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  29.66 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  27.12 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  46.81 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  27.5 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  27.73 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  26.05 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  30 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  27.87 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  29.17 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  25.42 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.69 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  28.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  47.62 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  34.92 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  37.31 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  26.45 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  28.03 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  28.46 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  30.99 
 
 		 294 aa  45.1  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  43.24 
 
 		 173 aa  43.9  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  40.48 
 
 		 304 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  56.67 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  47.37 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  30.77 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  44.74 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  41.67 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>