45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1356 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 107 aa  223  7e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  74.77 
 
 		 107 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  68.81 
 
 		 109 aa  158  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  64.49 
 
 		 107 aa  152  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  62.39 
 
 		 109 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  44.23 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  40.95 
 
 		 106 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  40.95 
 
 		 107 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  42.45 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  42.06 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.19 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  41.51 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  34.82 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 110 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  35.05 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  35.4 
 
 		 115 aa  71.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  30.84 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  35.24 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  38.2 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  34.23 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  32.14 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  35.71 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  36.94 
 
 		 110 aa  66.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 104 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  37.61 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  29.63 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  32.41 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  30.56 
 
 		 105 aa  62  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  25.71 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  31.48 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  31.48 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3089  DNA-directed RNA polymerase subunit M 1  33.02 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.995345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  31.13 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  31.19 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  30.91 
 
 		 109 aa  50.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  28.18 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  46.81 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  33.33 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  55.26 
 
 		 323 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  50 
 
 		 304 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  51.35 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  25.81 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  24.56 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  25 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  30.25 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>