21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57286 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  100 
 
 		 294 aa  606  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  33.33 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01160  positive transcription elongation factor, putative  30.57 
 
 		 349 aa  144  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  40.15 
 
 		 173 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  25.44 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  43.55 
 
 		 132 aa  57  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  35.29 
 
 		 111 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  46.81 
 
 		 107 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  31.62 
 
 		 123 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93034  predicted protein  33.33 
 
 		 528 aa  46.2  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0651398  normal  0.100945 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  29.29 
 
 		 111 aa  45.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  47.37 
 
 		 103 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  30.99 
 
 		 120 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  45.95 
 
 		 110 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  47.17 
 
 		 125 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  42.55 
 
 		 107 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45.95 
 
 		 124 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  46.15 
 
 		 85 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  48.65 
 
 		 109 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  45.95 
 
 		 110 aa  42.7  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  39.19 
 
 		 132 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>