19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04861 on replicon BN001303
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  100 
 
 
304 aa  630  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  33.33 
 
 
294 aa  182  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01160  positive transcription elongation factor, putative  32.46 
 
 
349 aa  157  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  39.5 
 
 
173 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  27.61 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01777  PHD finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09000)  33.33 
 
 
889 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0528439 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93034  predicted protein  46.15 
 
 
528 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0651398  normal  0.100945 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  47.62 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  34.33 
 
 
111 aa  46.6  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 
103 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  30.95 
 
 
105 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  30.95 
 
 
105 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  30.95 
 
 
105 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  50 
 
 
107 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  40.48 
 
 
120 aa  43.5  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  31.73 
 
 
124 aa  43.5  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  32.88 
 
 
105 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  47.62 
 
 
107 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  47.37 
 
 
110 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.02919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>