54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0989 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  100 
 
 		 124 aa  258  1e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  83.64 
 
 		 110 aa  203  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  81.82 
 
 		 110 aa  201  2e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  81.82 
 
 		 110 aa  199  9e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  50.44 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  48.65 
 
 		 114 aa  113  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  46.36 
 
 		 110 aa  106  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  48.18 
 
 		 103 aa  102  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  46.36 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  46.36 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  46.36 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  43.64 
 
 		 105 aa  97.4  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.18 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  44.04 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  39.45 
 
 		 104 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  41.23 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  36.36 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  36.11 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  38.18 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  42.34 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.66 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  34.82 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  36.52 
 
 		 109 aa  73.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  34.82 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  39.13 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  51.79 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  37.04 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  33.03 
 
 		 102 aa  67.8  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  32.14 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  34.23 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  34.82 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  37.61 
 
 		 108 aa  67  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  39.08 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  31.86 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  31.53 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  32.43 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  45 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  41.67 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.6 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  37.5 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  43.33 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  51.35 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  29.46 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  28.18 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24922  predicted protein  29.73 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  30.7 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  50 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  45.95 
 
 		 294 aa  44.3  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  29.82 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  31.73 
 
 		 304 aa  43.5  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  34.21 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  43.24 
 
 		 173 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>