15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1955 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  100 
 
 		 101 aa  197  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  67.42 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  39.77 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  40.35 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0776  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  47.92 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0730767  hitchhiker  0.00802939 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.6 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1177  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.33 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  40.35 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  46.15 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  42.11 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0855  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  47.62 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.40474  normal  0.643175 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0213  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  35 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  55.17 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  58.06 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  45.95 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>