50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0399 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 115 aa  240  3.9999999999999997e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  55.75 
 
 		 110 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  53.57 
 
 		 110 aa  121  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  50.44 
 
 		 124 aa  120  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  53.1 
 
 		 110 aa  120  7e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  50 
 
 		 114 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45.61 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  45.87 
 
 		 103 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  44.04 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  41.96 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  42.86 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  43.75 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  42.86 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  39.64 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.37 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  36.04 
 
 		 104 aa  88.2  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  40.74 
 
 		 109 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  36.36 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  42.73 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  34.58 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  37.5 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  45.35 
 
 		 85 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  36.61 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 102 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  38.05 
 
 		 108 aa  79.7  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  37.5 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  35.71 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  33.93 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  35.71 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  34.86 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  35.4 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  37.11 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  34.82 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  33.64 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  33.33 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  30.83 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  29.17 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  30.91 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0787  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  42.86 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.76775 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  28.83 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  32.5 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  29.46 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  26.67 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1955  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  58.06 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  42.5 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3089  DNA-directed RNA polymerase subunit M 1  24.07 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.995345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1847  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  48.28 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.261561 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  24.8 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1669  DNA-directed RNA polymerase, M/15 kDa subunit  51.72 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.31353  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  40 
 
 		 294 aa  40.4  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>