40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0448 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  100 
 
 		 96 aa  202  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  55.21 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  56.12 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  55.67 
 
 		 104 aa  107  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  55.21 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  48.96 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  45.83 
 
 		 103 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  47.42 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  48.31 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  48.96 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  42.27 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  43.3 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  43.3 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  43.3 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  39.33 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  39.58 
 
 		 103 aa  79.7  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  41.84 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  40.45 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  39.33 
 
 		 110 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40.66 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  39.58 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  39.58 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  35.05 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  37.11 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  36.08 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  40 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  35.23 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  35.35 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  34.38 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  35.63 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  30.93 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  30.3 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  32.95 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  34.48 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  44.19 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  28.92 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  28.72 
 
 		 111 aa  44.3  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  31.82 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  47.37 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  43.9 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>