14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10310 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  100 
 
 		 85 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  50 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  54.35 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  48.94 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  42.03 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  46.15 
 
 		 294 aa  42.7  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  46.34 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  43.9 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  40.54 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  47.22 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  30.91 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  31.25 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  36.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  41.67 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>