31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_10970 on replicon BN001304
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001304  ANIA_10970  DNA-directed RNA polymerase I 13.1 kDa polypeptide, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05480)  100 
 
 
121 aa  246  7e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  44.8 
 
 
123 aa  100  5e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02990  DNA-directed RNA polymerase i 13.7 kda polypeptide, putative  39.84 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14772  predicted protein  32.23 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0269583 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  32.5 
 
 
115 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  28.32 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10310  predicted protein  42.03 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  30.84 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  26.42 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  25.89 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  27.93 
 
 
106 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  30.36 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  28.57 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  28.83 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  30.17 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  34.21 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  56.67 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.44 
 
 
110 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  33.06 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  31.53 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  29.81 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  28.32 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  27.52 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  30.28 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  27.78 
 
 
103 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  51.43 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  28.83 
 
 
104 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  28.07 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  30.25 
 
 
107 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  25.24 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  25.24 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>