37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1395 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1395  transcription termination factor Tfs  100 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  69.23 
 
 		 104 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2091  transcription termination factor Tfs  66.99 
 
 		 103 aa  154  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  55.24 
 
 		 107 aa  120  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  50.96 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  51.92 
 
 		 103 aa  114  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0448  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  55.21 
 
 		 96 aa  103  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  43.14 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1026  transcription factor TFIIS  51.72 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.208667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  42.16 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  42.16 
 
 		 105 aa  97.4  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  40.95 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  42.16 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  41.75 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  42.73 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  40.38 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  41.35 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  40 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  36.61 
 
 		 115 aa  80.1  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  41.51 
 
 		 107 aa  79.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  38.18 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  37.61 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  38.18 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  41.28 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  40 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  39.05 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  36.36 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  32.08 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  36.7 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  33.64 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  33.03 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  33.03 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  25.21 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  26.36 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  28.3 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  30.77 
 
 		 123 aa  44.3  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>