13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119611 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  100 
 
 		 124 aa  262  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  42.31 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24922  predicted protein  38.74 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  29.09 
 
 		 110 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  25.45 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  29.73 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  29.09 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0439  transcription termination factor Tfs  30.09 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  29.46 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  29.46 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  25.66 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  28.57 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  23.15 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>