26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61635 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61635  DNA-directed RNA polymerase II  100 
 
 		 112 aa  235  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.158279 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119611  DNA-directed RNA polymerase II subunit 9, probable  42.31 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24922  predicted protein  46.23 
 
 		 111 aa  83.6  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  29.63 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0213  transcription termination factor Tfs  30.84 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  28.7 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1789  transcription termination factor Tfs  30.28 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.02919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  28.83 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  29.91 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0625  transcription termination factor Tfs  27.36 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0989  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.18 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  30.63 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  27.27 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  28.04 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  27.78 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  27.19 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  25.93 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1681  transcription termination factor Tfs  26.61 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0740  transcription termination factor Tfs  29.63 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0929752  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  25.45 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1244  transcription termination factor Tfs  28.7 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0156946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0674  transcription termination factor Tfs  28.7 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.133045  normal  0.0585587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.97 
 
 		 105 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  27.62 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  24.55 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  27.52 
 
 		 107 aa  40  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>