18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3089 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3089  DNA-directed RNA polymerase subunit M 1  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.995345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0231  transcription termination factor Tfs  46.67 
 
 		 106 aa  88.2  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.309601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3187  transcription termination factor Tfs  41.51 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.725935  normal  0.117173 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  33.02 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2365  transcription termination factor Tfs  37.74 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0970  Transcription factor TFIIS  40.37 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  32.71 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  32.38 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1343  transcription termination factor Tfs  34.29 
 
 		 102 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2752  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0911  transcription termination factor Tfs  27.18 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.71293  hitchhiker  0.0000000426816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2194  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  28.57 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.237105  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0878  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  30.48 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  25.96 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0804  transcription factor S  26.67 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.429011  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0399  transcription termination factor Tfs  24.07 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.227419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1998  transcription termination factor Tfs  26.89 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0149  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  24.76 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000712338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>