18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_5818 on replicon NC_009364
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009364  OSTLU_5818  predicted protein  100 
 
 		 173 aa  357  5e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00487195  normal  0.526788 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57286  predicted protein  40.15 
 
 		 294 aa  120  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.271408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01160  positive transcription elongation factor, putative  41.83 
 
 		 349 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04861  transcription elongation factor S-II (AFU_orthologue; AFUA_3G07670)  39.5 
 
 		 304 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.776551 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36634  predicted protein  40.27 
 
 		 323 aa  90.1  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93034  predicted protein  27.69 
 
 		 528 aa  54.7  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0651398  normal  0.100945 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00720  RNA polymerase III smallest subunit, putative  56.76 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690195  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47067  RNA polymerase III C11 subunit  37.31 
 
 		 111 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.749696 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13326  RNA polymerase C subunit 11 kDa  44.44 
 
 		 111 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.976633  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1860  DNA-directed RNA polymerase, subunit M  33.78 
 
 		 110 aa  44.7  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.791739 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48804  DNA-directed RNA polymerase I subunit A12 (RPA12)  50 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.673964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34016  predicted protein  43.24 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.698593 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2105  transcription termination factor Tfs  48.65 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1356  transcription termination factor Tfs  51.35 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0817 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1266  transcription termination factor Tfs  33.33 
 
 		 114 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1756  transcription termination factor Tfs  40.74 
 
 		 105 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0628  transcription termination factor Tfs  48.65 
 
 		 107 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0953  transcription termination factor Tfs  45.95 
 
 		 103 aa  40.8  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.337131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>