More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1485 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0243  cystathionine gamma-synthase  80.42 
 
 		 383 aa  640    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.814419 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1485  cystathionine gamma-synthase  100 
 
 		 383 aa  771    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.923651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0881  cystathionine gamma-synthase  79.63 
 
 		 386 aa  643    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.473462 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0316  cystathionine gamma-synthase  75.72 
 
 		 410 aa  607  9.999999999999999e-173  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1364  cystathionine gamma-synthase  52.49 
 
 		 385 aa  421  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00282102  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0180  Cystathionine gamma-synthase  45.08 
 
 		 376 aa  322  6e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0673  hypothetical protein  43.9 
 
 		 374 aa  299  5e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000849749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0592  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.89 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.19345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0684  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.24 
 
 		 422 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.228137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1667  Cystathionine gamma-synthase  44.12 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.441842  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03157  cystathionine gamma-synthase (CGS) (O-succinylhomoserine(Thiol)-lyase)  44.24 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0779579  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1991  cystathionine gamma-lyase  41.53 
 
 		 386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4155  cystathionine gamma-lyase  42.71 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.564931 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2677  cystathionine gamma-synthase  39.8 
 
 		 394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.181267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0802  cystathionine beta-lyase  43.51 
 
 		 394 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2799  cystathionine gamma-synthase  41.99 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000029873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3084  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.966725  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0710  cystathionine gamma-lyase  39.32 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2126  cystathionine gamma-lyase  41.89 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1156  Cystathionine gamma-lyase  42.39 
 
 		 386 aa  276  6e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1860  cystathionine gamma-synthase  41.4 
 
 		 393 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4268  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4600  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 377 aa  275  9e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4454  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 377 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1963  Cystathionine gamma-lyase  39.84 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.86057  normal  0.364371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2455  cystathionine gamma-synthase  40.89 
 
 		 392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.250511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0745  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3821  Cystathionine gamma-synthase  40.7 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3117  cystathionine gamma-lyase  42.27 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000114351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4219  cystathionine beta-lyase  40.26 
 
 		 377 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0455  cystathionine gamma-synthase  40.79 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2474  cystathionine beta-lyase  41.04 
 
 		 378 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4491  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4105  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4452  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0058  putative O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.08 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4116  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4505  cystathionine beta-lyase  40.78 
 
 		 377 aa  272  7e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2587  Cystathionine gamma-synthase  44.41 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0857878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3551  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.62 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4553  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.299968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4398  methionine gamma-lyase  41.05 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.011495  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.84 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4906  methionine gamma-lyase  41.21 
 
 		 391 aa  270  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8563  Cystathionine gamma-lyase  41.78 
 
 		 379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.78943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0472  methionine gamma-lyase  40.37 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0367851  hitchhiker  1.0145e-18 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2737  Cystathionine gamma-synthase  40.26 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00149474  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1401  cystathionine gamma-synthase  41.87 
 
 		 392 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2831  cystathionine gamma-lyase  39.28 
 
 		 381 aa  269  5.9999999999999995e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10022  normal  0.0538673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3171  cystathionine gamma-synthase  41.36 
 
 		 386 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0489  Cystathionine gamma-lyase  42.93 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3707  cystathionine gamma-lyase  40.33 
 
 		 390 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1914  cystathionine gamma-synthase  42.33 
 
 		 400 aa  269  7e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.145632  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0520  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.53 
 
 		 388 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0976  cystathionine gamma-lyase  42.13 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1668  cystathionine beta-lyase  42.55 
 
 		 392 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4371  cystathionine beta-lyase  41.33 
 
 		 387 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1985  cystathionine gamma-synthase  42.33 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.674412  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1227  cystathionine gamma-synthase  39.67 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4388  methionine gamma-lyase  40.11 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02525  Cystathionine gamma-synthase  38.76 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4772  methionine gamma-lyase  40 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0616  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.37 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0536  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  42.11 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4763  methionine gamma-lyase  40.16 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4791  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0979  cystathionine beta-lyase  42.08 
 
 		 377 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0163  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  37.76 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0863  cystathionine beta-lyase  41.07 
 
 		 387 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3614  cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 		 393 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3067  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  43.21 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0408285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4789  methionine gamma-lyase  39.9 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000018806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1499  Cystathionine gamma-synthase  44.27 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3439  cystathionine gamma-synthase  41.95 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4041  cystathionine gamma-synthase  41.78 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0512  cystathionine gamma-synthase  42.37 
 
 		 393 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.920975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0831  cystathionine gamma-synthase/cystathionine beta-lyase  41.19 
 
 		 380 aa  265  8e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0291716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1989  cysteine synthase / cystathionine gamma-synthase  43.72 
 
 		 378 aa  265  8.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.485291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0560  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.84 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4390  cystathionine beta-lyase  40.8 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3764  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3070  Cystathionine gamma-synthase  40.6 
 
 		 378 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1956  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3776  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.84 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3847  Cystathionine gamma-lyase  40.05 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.917287  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0564  O-succinylhomoserine (thiol)-lyase  41.84 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4594  cystathionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1294  cystathionine gamma-lyase  40.66 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1548  cystathionine gamma-synthase  40.55 
 
 		 383 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000154435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0500  cystathionine gamma-lyase  41.69 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2110  Cystathionine gamma-synthase  40.27 
 
 		 378 aa  264  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1769  cystathionine gamma-lyase  39.79 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000021447  hitchhiker  0.0000226631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4670  cystathionine gamma-synthase  40.96 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3249  cystathionine gamma-lyase  41.62 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05230  cystathionine gamma-lyase  41.96 
 
 		 394 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0085  Cystathionine gamma-synthase  44.12 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4337  cystathionine beta-lyase  40.53 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4056  cystathionine gamma-synthase  41.42 
 
 		 393 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0920  cystathionine gamma-synthase  41.71 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.684522  normal  0.205831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1626  cystathionine gamma-synthase  41.05 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3845  cystathionine gamma-lyase  38.06 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333846  normal  0.984605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>