More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0976 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 253 aa  497  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.385129  hitchhiker  0.0000000000432585 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.7 
 
 		 256 aa  382  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.183467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 		 253 aa  377  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.73 
 
 		 253 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 		 263 aa  148  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.64 
 
 		 276 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  29.71 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.23 
 
 		 258 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.46 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  29.31 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.88 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  31.84 
 
 		 256 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  31.33 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0566  ornithine carbamoyltransferase  31.22 
 
 		 256 aa  102  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000138704  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  29.83 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  29.44 
 
 		 284 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.92 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.6 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  32.5 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 		 277 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 266 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0283  polyamine ABC-transporter, inner membrane subunit  30.91 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.463421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 		 281 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1141  hypothetical protein  28.69 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1146  hypothetical protein  29.11 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  32.72 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.68 
 
 		 282 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00456  putrescine transport protein; permease  32.24 
 
 		 253 aa  95.5  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.033567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1012  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.18 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  32.02 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl509  spermidine/putrescine ABC transporter permease component  27.6 
 
 		 1080 aa  94.7  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  30.7 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  30.71 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.26536  normal  0.0890799 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  30.61 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  32.17 
 
 		 271 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 		 260 aa  93.2  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.61 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7680  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.13 
 
 		 313 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal  0.115465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  30.9 
 
 		 287 aa  92.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.07 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1669  ornithine carbamoyltransferase  31.67 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  28.51 
 
 		 268 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 273 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 		 267 aa  92  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 		 272 aa  91.7  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 		 271 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  32.51 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  31.69 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.163733  normal  0.0234889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  31.89 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  32.51 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 271 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  28.28 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5047  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0808772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2017  putrescine transport system permease protein  28.82 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6348  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2811  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.84 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1951  putrescine ABC transporter, permease protein  29 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0723  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  28.82 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0631  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  28.82 
 
 		 309 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3018  ornithine carbamoyltransferase  30.6 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  28.94 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  30.74 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  30.34 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6068  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.979336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>