More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03836 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 250 aa  507  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  73.84 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  72.15 
 
 		 240 aa  358  4e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  70.89 
 
 		 240 aa  352  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  50.87 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  41.49 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  38.08 
 
 		 241 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  43.72 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  45.22 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  43.1 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  38.16 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  41.59 
 
 		 237 aa  169  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  42.27 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  41.95 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  41.48 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  41.35 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  41.36 
 
 		 233 aa  164  9e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  39.32 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  41.3 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  43.35 
 
 		 241 aa  158  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  37.23 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  40.1 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  36.48 
 
 		 236 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  36.67 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  37.2 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  44.14 
 
 		 228 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  35.23 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  34.63 
 
 		 233 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  30.45 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1753  glutamine amidotransferase class-I  31.67 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  37.5 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  34.87 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3785  glutamine amidotransferase class-I  32.28 
 
 		 258 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134927  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0041  glutamine amidotransferase class-I  30.33 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  29.35 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2047  glutamine amidotransferase class-I  33.71 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  32.02 
 
 		 276 aa  89.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3437  glutamine amidotransferase class-I  33.97 
 
 		 305 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.136492 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  32.65 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3746  glutamine amidotransferase class-I  35.2 
 
 		 286 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.47135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  40.28 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1121  glutamine amidotransferase class-I  32.99 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.997537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  31.46 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3149  glutamine amidotransferase class-I  41.43 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1763  glutamine amidotransferase class-I  35.53 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  30.93 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2614  glutamine amidotransferase class-I  36.81 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  33.68 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  29.34 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  39.29 
 
 		 513 aa  81.6  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  39.86 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.05 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  36.94 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  35.42 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3633  glutamine amidotransferase class-I  32.97 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.125092  normal  0.0172183 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  34.52 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  35.86 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  38.19 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0483  glutamine amidotransferase class-I  28.9 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.88 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0299  glutamine amidotransferase class-I  32.47 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  29.74 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  28.95 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  32.2 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0844  glutamine amidotransferase class-I  38.26 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.113234  normal  0.319271 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0523  glutamine amidotransferase, class I  31.21 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.947174  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  40.91 
 
 		 516 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  35.37 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  30.65 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  31.95 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  31.71 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2104  glutamine amidotransferase class-I  29.35 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.503763 
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  40.28 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  34.38 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  33.12 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  28.42 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1182  glutamine amidotransferase class-I  28.14 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  34.23 
 
 		 509 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  31.5 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  33.12 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19600  GMP synthase family protein  35.09 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  34.42 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3848  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.114524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3243  glutamine amidotransferase  34 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  34.27 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  34.42 
 
 		 513 aa  73.9  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  39.46 
 
 		 515 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  31.68 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  28.4 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2529  GMP synthase glutamine amidotransferase subunit  29.56 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.777754 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  35.17 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  33.99 
 
 		 513 aa  72.4  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  32.39 
 
 		 189 aa  72  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  34.59 
 
 		 513 aa  72  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  33.56 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  28.31 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  31.58 
 
 		 189 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>