42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03553 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2865  hypothetical protein  42.58 
 
 		 883 aa  760    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.151414  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03553  RecF/RecN/SMC N terminal domain protein  100 
 
 		 884 aa  1810    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262366  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3230  hypothetical protein  36.62 
 
 		 896 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1493  SMC domain protein  36.4 
 
 		 892 aa  523  1e-147  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3193  PHP domain protein  35.2 
 
 		 894 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2794  hypothetical protein  35.2 
 
 		 894 aa  484  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1607  SMC domain-containing protein  28.13 
 
 		 909 aa  253  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1734  SMC domain-containing protein  27.67 
 
 		 906 aa  223  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195763 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1286  hypothetical protein  31.05 
 
 		 633 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1358  hypothetical protein  31.2 
 
 		 633 aa  223  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.019808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2715  hypothetical protein  31.05 
 
 		 633 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.320753  hitchhiker  0.00854437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1737  hypothetical protein  27.3 
 
 		 617 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0183917  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2527  hypothetical protein  26.56 
 
 		 889 aa  184  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000761316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1891  hypothetical protein  26.73 
 
 		 877 aa  177  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5033  PHP-like  24.68 
 
 		 894 aa  156  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0193  SMC domain protein  22.05 
 
 		 895 aa  132  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.711323  normal  0.0164189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1540  SMC domain-containing protein  23.23 
 
 		 943 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.719038 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1108  hypothetical protein  41.73 
 
 		 853 aa  98.6  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3009  phosphotransferase domain-containing protein  39.06 
 
 		 931 aa  87.8  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2629  phosphotransferase domain-containing protein  38.1 
 
 		 929 aa  85.9  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.525375  normal  0.100409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0840  hypothetical protein  38.24 
 
 		 937 aa  80.5  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0968  hypothetical protein  38.24 
 
 		 916 aa  80.1  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.386021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1048  SMC domain-containing protein  37.9 
 
 		 995 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1748  SMC domain protein  38.1 
 
 		 1011 aa  79.7  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.259166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3041  ABC transporter  38.21 
 
 		 1028 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.905111  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0667  DNA repair ATPase  39.69 
 
 		 888 aa  78.6  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3605  SMC domain-containing protein  39.02 
 
 		 955 aa  78.2  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.637524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4740  hypothetical protein  35.81 
 
 		 972 aa  78.2  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.462121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2437  hypothetical protein  38.1 
 
 		 428 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920457  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5854  ABC transporter  35.48 
 
 		 1028 aa  75.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0676  DNA repair ATPase  38.28 
 
 		 897 aa  75.5  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5575  hypothetical protein  36.94 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5978  hypothetical protein  36.94 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.484158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1611  putative DNA repair ATPase  33.56 
 
 		 966 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.230196  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2772  hypothetical protein  38 
 
 		 992 aa  61.6  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4550  hypothetical protein  36.63 
 
 		 990 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12740  hypothetical protein  23.75 
 
 		 938 aa  59.3  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00274818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1522  hypothetical protein  28.42 
 
 		 709 aa  56.2  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.541364  hitchhiker  0.00000000000000176755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  22.04 
 
 		 236 aa  52.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0976  ABC transporter ATPase  28.15 
 
 		 516 aa  47  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  23.1 
 
 		 1232 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  24.15 
 
 		 561 aa  44.3  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>