More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3304 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  100 
 
 		 398 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  95.73 
 
 		 398 aa  714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  78.24 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  68.44 
 
 		 404 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  66.58 
 
 		 404 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  64.57 
 
 		 405 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  65.21 
 
 		 405 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  63.73 
 
 		 405 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  63.73 
 
 		 405 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  63.73 
 
 		 405 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  65.23 
 
 		 405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  69.57 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  63.06 
 
 		 400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  62.8 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  62.8 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  68.16 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  65.15 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  62.37 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  62.63 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  65.08 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  65.33 
 
 		 402 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  51.57 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 399 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  48.7 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  48.7 
 
 		 389 aa  331  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  52.37 
 
 		 401 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  48.11 
 
 		 396 aa  316  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  49.13 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  46.65 
 
 		 407 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 402 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  49.09 
 
 		 402 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  48.66 
 
 		 413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  52.52 
 
 		 408 aa  277  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  45.55 
 
 		 405 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  43.32 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.39 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 385 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.4 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.4 
 
 		 406 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.43 
 
 		 392 aa  259  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.63 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 399 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 413 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 399 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 394 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  41.19 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  41.19 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  41.19 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  40.77 
 
 		 394 aa  226  7e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  39.9 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 405 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  40.3 
 
 		 406 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 415 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 389 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2960  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0152929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.54 
 
 		 394 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3118  major facilitator family protein  41.6 
 
 		 394 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.126701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 394 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  37.7 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  40.56 
 
 		 422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 		 389 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0894  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  36.88 
 
 		 411 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3738  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 399 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2698  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746968  normal  0.820419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  37.34 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.11 
 
 		 387 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 404 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 399 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.11 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 410 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1187  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 400 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.15 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.15 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>