More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6237 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_71910  glycosyltransferase WbpZ  97.64 
 
 		 381 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6237  glycosyltransferase WbpZ  100 
 
 		 381 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5688  glycosyl transferase, group 1  78.07 
 
 		 376 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.285621  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1236  glycosyl transferase, group 1  62.83 
 
 		 379 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  59.89 
 
 		 370 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1411  glycosyl transferase group 1  57.95 
 
 		 376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1802  glycosyl transferase WbpZ  56.52 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0763869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3274  glycosyl transferase group 1  53.49 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0540  glycosyl transferase, group 1 family protein  52.3 
 
 		 369 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180191  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2166  glycosyl transferase, group 1 family protein  50 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2637  lipopolysaccharide biosynthesis protein RfbV  45.92 
 
 		 370 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1275  glycosyl transferase, group 1  43.58 
 
 		 377 aa  295  7e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  39.79 
 
 		 367 aa  236  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 		 385 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  40.67 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  40.35 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  35.27 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  33.07 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 369 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 385 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4206  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2777  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2891  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  29.66 
 
 		 638 aa  129  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0495  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 613 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 		 406 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  35.11 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  27.5 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  27.03 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.73 
 
 		 388 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  30.43 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1064  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  26.54 
 
 		 399 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 385 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.48 
 
 		 385 aa  80.5  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  27.34 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  25.09 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 		 360 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  23.3 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1590  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00816719  decreased coverage  0.0063014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  34.66 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  28.48 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2445  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.28 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.78 
 
 		 446 aa  72.8  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0368  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.85 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.31592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 		 536 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.06 
 
 		 359 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5879  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>