More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2061 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2061  putative two-component sensor  100 
 
 		 431 aa  870    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.574753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24340  putative two-component sensor  93.04 
 
 		 431 aa  777    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.166321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2810  histidine kinase  33.92 
 
 		 425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1973  histidine kinase  32.73 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.73664 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3675  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2297  Signal transduction histidine kinase-like  24.3 
 
 		 446 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247505  hitchhiker  0.000082991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2252  histidine kinase  29.47 
 
 		 410 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4638  sensor histidine kinase  31.58 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001594  two-component system sensor protein  28.75 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000479105  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04467  two-component system (histidine kinase) sensor protein requried for AvrXa21 activity H (raxH)  36.94 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0692  histidine kinase A domain-containing protein  29.52 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0334  histidine kinase  31.91 
 
 		 418 aa  114  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000559138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3576  histidine kinase A domain-containing protein  29.14 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2523  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.311676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2374  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.171494  normal  0.151024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2642  sensor histidine kinase  29.48 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.244154  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05571  sensory transduction protein kinase  27.59 
 
 		 413 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2610  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2444  Signal transduction histidine kinase-like  27.16 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.215818 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2720  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.894758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353371 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04658  two-component system sensor protein  26.7 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0314695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3797  ATPase domain-containing protein  28.47 
 
 		 413 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 423 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2130  histidine kinase  30.74 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0597631 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0417  putative sensor kinase protein  29.2 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4327  histidine kinase A domain-containing protein  28.94 
 
 		 415 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0619  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.869359  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4622  sensor histidine kinase  28.47 
 
 		 413 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339832  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4195  histidine kinase A domain-containing protein  28.94 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02793  histidine kinase  28.01 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3010  histidine kinase A domain-containing protein  27.95 
 
 		 420 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.728657  normal  0.501785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4497  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2833  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.643319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003061  two-component system sensor protein  31.13 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0147  signal transduction histidine kinase-like protein  33.17 
 
 		 404 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4006  histidine kinase A domain-containing protein  30.97 
 
 		 413 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4951  putative two-component sensor  29.66 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1725  two component sensor histidine kinase  26.8 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0941  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1866  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 422 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000017519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1046  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56940  putative two-component sensor  29.66 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1930  histidine kinase  32.03 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.824341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0970  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0878793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4485  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960944 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1030  histidine kinase  33.87 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.836788 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 585 aa  80.9  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3631  histidine kinase  26.09 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02305  two-component system sensor protein  31.48 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2731  twp-component sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1188  sensor histidine kinase, putative  25.75 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0137  sensor histidine kinase  27.45 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.204639 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2105  two-component system, sensor protein  30.77 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 445 aa  75.9  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0159551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0707  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4373  sensor histidine kinase ColS  28.72 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4554  histidine kinase  26.49 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00930403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0818  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2038  ATP-binding region ATPase domain protein  27.07 
 
 		 473 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1235  sensor histidine kinase  24.37 
 
 		 353 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000222357  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1357  sensor histidine kinase  24.37 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4069  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00769633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17790  sensory histidine protein kinase, two-component, ColS  29.55 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334576  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0885  histidine kinase  25.13 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.096312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4932  histidine kinase  26.32 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0719  sensor histidine kinase  24.93 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3911  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.697647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0477  sensor protein BasS/PmrB  28.05 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000367453  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1127 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2139  histidine kinase  32.38 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  27.84 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0309  sensor protein BasS/PmrB  27.34 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.327284  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.92 
 
 		 950 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 979 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3439  Signal transduction histidine kinase-like  23.53 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359307 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0643  histidine kinase  31.25 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0153  histidine kinase  28.01 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.519807  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3608  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 355 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000312076  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1163  Signal transduction histidine kinase sensor  25.66 
 
 		 437 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3742  sensor protein BasS/PmrB  28.52 
 
 		 355 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 		 925 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4725  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 614 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269083  normal  0.0435637 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 		 1007 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000711716  decreased coverage  0.0000471047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>