More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4425 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4425  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 255 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4371  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  76.47 
 
 		 277 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3869  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  73.62 
 
 		 295 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  0.720303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2156  ABC transporter related  70.47 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5514  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.96 
 
 		 261 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.595344  hitchhiker  0.000996868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3462  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 		 254 aa  311  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5235  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 		 261 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.251626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3700  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 261 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0280  ABC transporter related  60.96 
 
 		 261 aa  307  9e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1748  ABC transporter related  60.56 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0064  polar amino acid ABC transporter ATPase  58.57 
 
 		 261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.54 
 
 		 282 aa  296  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4597  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP- binding protein  58 
 
 		 271 aa  293  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29460  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  60.56 
 
 		 254 aa  293  3e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  57.6 
 
 		 257 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5218  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  57.37 
 
 		 278 aa  291  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3170  hypothetical protein  58.57 
 
 		 261 aa  288  7e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0306  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  57.37 
 
 		 267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.97 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  57.54 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 256 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54 
 
 		 274 aa  270  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0380477  normal  0.0820777 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  57.83 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  56.35 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  53.01 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1502  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  54.84 
 
 		 248 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.51397  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  56.68 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  55.37 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2882  ABC transporter related  56.33 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0937154  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  56.28 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  55.78 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  55.78 
 
 		 254 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  53.39 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  56.05 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4837  ABC transporter related  55.78 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0177235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2981  ABC transporter related  55.56 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.82 
 
 		 254 aa  260  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.96 
 
 		 255 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  52.21 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07290  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 245 aa  260  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219911  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  55.87 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  54.18 
 
 		 243 aa  259  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  54.98 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  52.59 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  54.07 
 
 		 264 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0669  ABC transporter related  52.67 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0798533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.59 
 
 		 257 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2965  ABC transporter  54.76 
 
 		 265 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0568085  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  52.61 
 
 		 263 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  58.57 
 
 		 254 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  54.98 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5577  ABC transporter related  54.03 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  52.19 
 
 		 257 aa  258  6e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  53.66 
 
 		 264 aa  258  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  53.97 
 
 		 259 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  53.88 
 
 		 264 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  52.21 
 
 		 263 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  51.79 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  55.87 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  53.97 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  52.99 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  54.62 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3147  ABC transporter related  51.18 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.383516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  53.88 
 
 		 266 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  52.89 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  52.65 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0778  polar amino acid ABC transporter ATPase  55.38 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799972  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  54.58 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  53.31 
 
 		 259 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  52.57 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  54.18 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  52.89 
 
 		 259 aa  255  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.03 
 
 		 254 aa  254  6e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  54.18 
 
 		 240 aa  255  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  53.47 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  53.47 
 
 		 274 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3408  ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  53.47 
 
 		 266 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  51.39 
 
 		 246 aa  254  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  53.47 
 
 		 266 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  56.18 
 
 		 269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  52.85 
 
 		 246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.47 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 242 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>