More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0094 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 		 216 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  99.07 
 
 		 237 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  97.22 
 
 		 224 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  94.44 
 
 		 224 aa  423  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  81.86 
 
 		 216 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  75.35 
 
 		 215 aa  332  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  74.64 
 
 		 221 aa  321  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  74.64 
 
 		 221 aa  321  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  55.26 
 
 		 222 aa  206  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  48.54 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  48.54 
 
 		 221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  48.54 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  48.54 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  43.19 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  44.23 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  48.06 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  48.06 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  49.21 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  45.24 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  46.67 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  44.5 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  47.18 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  45.03 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  43.81 
 
 		 216 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  45.41 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.56 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  41.58 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.58 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.56 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  35.68 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.22 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  35.85 
 
 		 291 aa  134  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  37.32 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.05 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.27 
 
 		 220 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  36.36 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.89 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  37.56 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  37.38 
 
 		 225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.54 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  38.21 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.13 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.75 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.6 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  33.65 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  35.42 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  35.89 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  33.33 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.27 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.98 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.22 
 
 		 223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.1 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  32.98 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  31.34 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  32.52 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.52 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.84 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.32 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.86 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.36 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.22 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.7 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0500332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  35.65 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.28 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.22 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  23.18 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  30.33 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  30.26 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  30.92 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  30.1 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.49 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.73 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  26.05 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  29.27 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  29.51 
 
 		 212 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.36 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  27.18 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.26 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  28.02 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  26.92 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0627  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.76 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  30.73 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.7 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  27.51 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  25.87 
 
 		 231 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  26.4 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.4 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  25.5 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>