More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_61312 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_61312  predicted protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.243713  normal  0.492851 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09357  short-chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02370)  36.82 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00364064 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  37.65 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  34.67 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3561  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3341  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3306  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3602  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0750697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3555  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000931047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3655  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1662  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.637972  hitchhiker  0.000000702398 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3565  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.578221  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  33.94 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3256  short chain dehydrogenase  32.55 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7025  short chain dehydrogenase  32.65 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0959  short chain dehydrogenase  32.91 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0597094 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0894  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.211983  normal  0.0749879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 250 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2223  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.637126  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3250  short chain dehydrogenase  30.83 
 
 		 249 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0558976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0122  oxidoreductase  30.85 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.49595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2989  short-chain alcohol dehydrogenase/reductase  31.8 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1255  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.04 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 		 226 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00421455  normal  0.304991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 		 267 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  31.49 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 		 251 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3152  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0242299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3164  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 291 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3214  short chain dehydrogenase  38.61 
 
 		 294 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.592331  normal  0.549818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  35.32 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1035  short chain dehydrogenase  32.63 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.158204 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  28.5 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.87 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  28.99 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0914  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.66283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  30.65 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 226 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 250 aa  92.8  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.331162 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 260 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0717939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1778  oxidoreductase, short chain dehydrogenase  30.96 
 
 		 228 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1071  short chain dehydrogenase  33.18 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.23 
 
 		 227 aa  92  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0180181  normal  0.277757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 		 239 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.97 
 
 		 248 aa  91.7  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  28.25 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.537071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19210  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.6 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 		 338 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10628  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  33.02 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.06 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  28.25 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  32.35 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.05 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 244 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 		 317 aa  89.7  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1193  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  29.73 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  28.05 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.17 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.17 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  35.82 
 
 		 283 aa  89  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000130997  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.12 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6051  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0202908  normal  0.993323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 		 246 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.56 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  29.84 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  30.28 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.58 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00161492  normal  0.104649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24130  short-chain alcohol dehydrogenase  31.37 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.969986 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4628  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09810  short-chain alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0913042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>