More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43167 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43167  high affinity nicotinic acid plasma membrane permease  100 
 
 		 462 aa  944    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.460781 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04150  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13090)  54.07 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174123  normal  0.821758 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05650  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0116701  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02282  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06290)  28.07 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11116  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02730)  27.19 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60854  transporter of Nicotinic Acid  26.8 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.377771  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00993  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11320)  26.39 
 
 		 496 aa  156  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04690  transporter, putative  27.38 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04960  conserved hypothetical protein  26.43 
 
 		 533 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.695545  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01110  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11820)  27.68 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  0.983602 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  27.22 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09010  MFS nicotinic acid transporter Tna1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03820)  26.59 
 
 		 503 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 437 aa  134  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3642  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.48403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05810  nicotinamide mononucleotide permease, putative  26.71 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  23.45 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01681  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00130)  24.7 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.235626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  25.72 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  23.03 
 
 		 432 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08936  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.57244  normal  0.266871 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07027  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04250)  22.55 
 
 		 455 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3771  major facilitator family transporter  25.49 
 
 		 435 aa  126  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726809  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5460  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 450 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3978  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 435 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0632064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  27.53 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2307  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  25.23 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  25.53 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  25.53 
 
 		 440 aa  124  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00614  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 		 507 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252734  normal  0.815893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3541  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5134  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 		 433 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2592  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132896  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3214  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 440 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1492  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  27.27 
 
 		 432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1709  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02344  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G00710)  24.73 
 
 		 493 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5847  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.677532  hitchhiker  0.000346248 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02590  MFS transporter, putative  30.67 
 
 		 512 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6175  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  25.85 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 440 aa  120  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5690  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.296143 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10075  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01812)  21.96 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0433622 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01850  MFS transporter, putative  32.32 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.278223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  27.88 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 441 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3366  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  27.13 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3226  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.255532  normal  0.960957 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  24.19 
 
 		 445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3940  major facilitator family transporter  26.71 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.100608  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51300  major facilitator superfamily (MFS) permease  30 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 437 aa  117  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1897  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 488 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.134461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3789  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 428 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.678172  normal  0.508893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05840  tartrate transporter  27.15 
 
 		 472 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3262  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0410092  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0637  major facilitator superfamily transporter  25.38 
 
 		 434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0039  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 438 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.257163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0364  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.305692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0374  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0353  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00469772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0888  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01457  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04470)  25 
 
 		 496 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03450  tartrate transporter, putative  24.53 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.562433  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3575  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.535313 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2542  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>