More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47594 on replicon NC_011682
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011682  PHATRDRAFT_47594  predicted protein  100 
 
 
599 aa  1195    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0931  thylakoidal processing peptidase  37.31 
 
 
190 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778333  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4839  signal peptidase I  36.13 
 
 
209 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_5885  predicted protein  34.38 
 
 
199 aa  90.5  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4484  signal peptidase I  33.33 
 
 
200 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.130088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4420  signal peptidase I  33.33 
 
 
200 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0250  signal peptidase I  36.18 
 
 
197 aa  85.1  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.904614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0530  signal peptidase I  34.03 
 
 
197 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18791  leader peptidase I  32.96 
 
 
206 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41529 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1661  signal peptidase I  31.55 
 
 
220 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1532  signal peptidase I  31.96 
 
 
187 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00110114  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1310  thylakoidal processing peptidase  31.75 
 
 
198 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4691  signal peptidase I  30.89 
 
 
214 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1226  signal peptidase I  33.33 
 
 
190 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9241  predicted protein  34.88 
 
 
178 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07511  Signal peptidase I  32.64 
 
 
234 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0918  signal peptidase I  33.02 
 
 
271 aa  79.7  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3677  signal peptidase I  31.28 
 
 
208 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0487  thylakoidal processing peptidase  34.38 
 
 
220 aa  79.3  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0584817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1121  thylakoidal processing peptidase  36.05 
 
 
196 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0767152  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0121  thylakoidal processing peptidase  31.16 
 
 
215 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2178  thylakoidal processing peptidase  26.32 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0200  signal peptidase I  30.37 
 
 
193 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0195  signal peptidase I  30.37 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.597616  normal  0.0662896 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2722  signal peptidase I  28.96 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0745119  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1659  peptidase S26A, signal peptidase I  29.11 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1310  signal peptidase I  35.48 
 
 
289 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0016  signal peptidase I  31.78 
 
 
324 aa  73.2  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.237487  normal  0.297255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4427  signal peptidase I  30.81 
 
 
217 aa  72.4  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.287524  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1410  signal peptidase I  32.64 
 
 
173 aa  72  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0618865  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06621  leader peptidase I  32.46 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.186965  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0042  leader peptidase I  31.94 
 
 
188 aa  71.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.643112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3289  signal peptidase I  32.98 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000862301  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0699  peptidase S26A, signal peptidase I  33.5 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0691424  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1355  signal peptidase I  34.38 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1199  signal peptidase I  35.35 
 
 
290 aa  70.5  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526786  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1335  peptidase S26A, signal peptidase I  30.41 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0446505  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0478  thylakoidal processing peptidase  33.91 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0985  signal peptidase I  32.71 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60179  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10441  leader peptidase I  32.24 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0514  Signal peptidase I  27.95 
 
 
219 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.299023  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1836  signal peptidase I  31.39 
 
 
215 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387891  normal  0.998113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0509  signal peptidase I  32.54 
 
 
216 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.82955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0662  signal peptidase I  30.37 
 
 
174 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00185516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3452  signal peptidase I  29.52 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.987  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2652  signal peptidase I  29.52 
 
 
349 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3025  signal peptidase I  27.64 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1653  signal peptidase I  32.23 
 
 
236 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  30.54 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3523  signal peptidase I  28.82 
 
 
243 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1119  signal peptidase I  30.41 
 
 
240 aa  67  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.606635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2149  signal peptidase I  28.82 
 
 
243 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10040  signal peptidase I  29.49 
 
 
266 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3026  signal peptidase I  28.91 
 
 
262 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1192  signal peptidase I  30.73 
 
 
192 aa  65.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47370  putative signal peptidase  34.12 
 
 
179 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.627585  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0972  signal peptidase I  33.16 
 
 
184 aa  65.1  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000604372  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3501  signal peptidase I  28.91 
 
 
216 aa  65.1  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00001185  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4088  signal peptidase I  35.33 
 
 
187 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  29.8 
 
 
248 aa  64.3  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  29.8 
 
 
248 aa  64.3  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3855  signal peptidase I  30.24 
 
 
275 aa  63.9  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3169  signal peptidase I  29.15 
 
 
200 aa  63.9  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.559115  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05711  Signal peptidase I  25.91 
 
 
230 aa  63.9  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.818825  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2718  signal peptidase I  30.18 
 
 
198 aa  63.9  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  28.64 
 
 
268 aa  63.9  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3418  signal peptidase I  29.33 
 
 
360 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06621  leader peptidase I  27.98 
 
 
194 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.929387  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05701  Signal peptidase I  25.22 
 
 
219 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  30.29 
 
 
342 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0667  signal peptidase I  30.57 
 
 
338 aa  62.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.607468  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_975  signal peptidase I  29.8 
 
 
186 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  29.44 
 
 
299 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  30.72 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2328  signal peptidase I  31.12 
 
 
225 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0027  signal peptidase I  28.35 
 
 
176 aa  62.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000806265  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1003  signal peptidase I  29.8 
 
 
189 aa  63.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  30.33 
 
 
297 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  30.33 
 
 
297 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2191  peptidase S26A, signal peptidase I  27.51 
 
 
189 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06711  leader peptidase I  29.31 
 
 
194 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5920  signal peptidase I  31.53 
 
 
299 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0083042  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05401  Signal peptidase I  25.58 
 
 
219 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1140  signal peptidase I  29.41 
 
 
226 aa  61.2  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0984  signal peptidase I  29.15 
 
 
291 aa  61.2  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.376271 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06321  leader peptidase I  27.98 
 
 
194 aa  61.2  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1846  Signal peptidase I  26.01 
 
 
231 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.10731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1518  signal peptidase I  32.06 
 
 
469 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.0182553 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1767  signal peptidase I  29.44 
 
 
226 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000654084  normal  0.0637155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  29.03 
 
 
322 aa  60.8  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  29.52 
 
 
325 aa  61.2  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  29.03 
 
 
322 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  30 
 
 
299 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  27.01 
 
 
321 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05771  Signal peptidase I  26.15 
 
 
211 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1641  signal peptidase I  30.53 
 
 
185 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1556  signal peptidase I  30.77 
 
 
311 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.329256  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2330  signal peptidase I  31.12 
 
 
221 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000787918  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12917  signal peptidase I lepB (leader peptidase I)  29.26 
 
 
294 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.710177 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1882  signal peptidase I  31.12 
 
 
225 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>