More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45661 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_45661  muts-like protein 4  100 
 
 		 1191 aa  2476    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  34.15 
 
 		 904 aa  197  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  32.76 
 
 		 881 aa  194  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  33.08 
 
 		 859 aa  192  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  30.17 
 
 		 793 aa  191  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  30.94 
 
 		 872 aa  190  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  27.02 
 
 		 872 aa  189  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0008  DNA mismatch repair protein MutS  31.86 
 
 		 848 aa  188  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  26.18 
 
 		 1088 aa  188  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 		 854 aa  188  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  29.85 
 
 		 793 aa  187  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2347  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 		 860 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.836402  normal  0.482784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 		 819 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  32.35 
 
 		 828 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 861 aa  184  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  32.18 
 
 		 856 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 861 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 856 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  32.87 
 
 		 868 aa  184  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  32.14 
 
 		 903 aa  183  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  28.93 
 
 		 910 aa  183  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  30.95 
 
 		 840 aa  183  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  32.51 
 
 		 853 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  30.46 
 
 		 850 aa  182  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 856 aa  182  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  31.43 
 
 		 855 aa  182  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  32.43 
 
 		 861 aa  182  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  33.08 
 
 		 858 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 856 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  33.85 
 
 		 889 aa  181  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  37.04 
 
 		 823 aa  181  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  30.42 
 
 		 872 aa  181  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  31.68 
 
 		 856 aa  181  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0068  DNA mismatch repair protein MutS  32.22 
 
 		 852 aa  181  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  30.43 
 
 		 862 aa  180  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  36.33 
 
 		 860 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  31.19 
 
 		 856 aa  180  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68406  predicted protein  37.42 
 
 		 999 aa  179  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.094593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  32.6 
 
 		 863 aa  178  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  32.27 
 
 		 872 aa  178  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  33.62 
 
 		 884 aa  177  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  33.62 
 
 		 884 aa  177  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  34.26 
 
 		 859 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  31.64 
 
 		 817 aa  177  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3383  DNA mismatch repair protein MutS  32.78 
 
 		 856 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.130934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18351  DNA mismatch repair protein MutS  31.86 
 
 		 914 aa  177  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  32.96 
 
 		 883 aa  177  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  32.51 
 
 		 859 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2603  DNA mismatch repair protein MutS  33.09 
 
 		 891 aa  176  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  27.46 
 
 		 846 aa  176  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  32.05 
 
 		 905 aa  177  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  33.16 
 
 		 857 aa  176  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  27.17 
 
 		 846 aa  176  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3751  DNA mismatch repair protein MutS  36.88 
 
 		 855 aa  176  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  32.38 
 
 		 855 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  31.51 
 
 		 853 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  27.62 
 
 		 927 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  31.61 
 
 		 894 aa  176  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  31.27 
 
 		 869 aa  175  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  31.25 
 
 		 896 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0434  DNA mismatch repair protein MutS  30.48 
 
 		 853 aa  175  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0558205  normal  0.0590484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  33.68 
 
 		 897 aa  175  3.9999999999999995e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18541  DNA mismatch repair protein MutS  32.61 
 
 		 913 aa  175  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18351  DNA mismatch repair protein MutS  32.34 
 
 		 913 aa  175  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0273  DNA mismatch repair protein MutS  32.48 
 
 		 1040 aa  175  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.601662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0247  DNA mismatch repair protein MutS  31.67 
 
 		 1058 aa  174  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  29.9 
 
 		 871 aa  174  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  29.89 
 
 		 902 aa  174  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  32.55 
 
 		 868 aa  174  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 858 aa  173  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  29.66 
 
 		 878 aa  173  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  31.42 
 
 		 861 aa  173  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  31.04 
 
 		 872 aa  173  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 870 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 		 851 aa  172  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 		 851 aa  172  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  39.86 
 
 		 870 aa  172  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  33.52 
 
 		 851 aa  172  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21131  DNA mismatch repair protein MutS  31.97 
 
 		 926 aa  172  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0652427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  33.24 
 
 		 854 aa  172  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 		 855 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19604  predicted protein  33.04 
 
 		 363 aa  172  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  32.93 
 
 		 859 aa  171  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  31.4 
 
 		 892 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.76 
 
 		 873 aa  171  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  30.27 
 
 		 862 aa  171  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  32.72 
 
 		 862 aa  171  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  31.04 
 
 		 855 aa  171  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 894 aa  170  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1159  DNA mismatch repair protein MutS  32.13 
 
 		 850 aa  171  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0179722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  37.82 
 
 		 918 aa  170  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0292  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 784 aa  171  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.518405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1657  DNA mismatch repair protein MutS  44.71 
 
 		 868 aa  171  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 901 aa  171  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  31.75 
 
 		 858 aa  170  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  32.49 
 
 		 854 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 890 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 892 aa  170  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 		 890 aa  170  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  31.13 
 
 		 892 aa  170  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>