More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_13123 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_13123  predicted protein  100 
 
 		 328 aa  679    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50961  predicted protein  53.27 
 
 		 357 aa  360  3e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46874  predicted protein  41.09 
 
 		 396 aa  242  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183113  normal  0.846713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06207  pyruvate dehydrogenase kinase (AFU_orthologue; AFUA_2G11900)  39.27 
 
 		 405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0955633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90317  predicted protein  37.12 
 
 		 517 aa  201  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00360  hypothetical protein  36.69 
 
 		 462 aa  195  8.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04400  kinase, putative  37.29 
 
 		 432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15081  predicted protein  37.89 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10800  mitochondrial pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13600)  30.37 
 
 		 483 aa  155  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.403507  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_09461  pyruvate dehydrogenase kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03240)  27.17 
 
 		 442 aa  139  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29203  probable pyruvate dehydrogenase kinase  25.41 
 
 		 517 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0107384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28836  predicted protein  26.12 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.640365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46264  predicted protein  27.85 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 682 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  27.98 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01633  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.77 
 
 		 784 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1260 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0588  histidine kinase  28.68 
 
 		 903 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1223 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  27.17 
 
 		 457 aa  53.1  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 		 593 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.16 
 
 		 462 aa  53.1  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1948  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.65 
 
 		 785 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000151303  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.62 
 
 		 581 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  33.09 
 
 		 737 aa  52.8  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 652 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 1744 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  26.71 
 
 		 662 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.38 
 
 		 927 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0667  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 859 aa  51.6  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.370657 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  30.89 
 
 		 788 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1155 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1749  ATPase domain-containing protein  27.54 
 
 		 602 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 827 aa  50.8  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 612 aa  50.8  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 1124 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0478  histidine kinase  32.56 
 
 		 560 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4802  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 910 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.150201 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3431  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 756 aa  50.1  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 		 597 aa  50.1  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  25.34 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 801 aa  49.7  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 798 aa  49.7  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  30.56 
 
 		 810 aa  50.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 1278 aa  49.7  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 535 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  27.22 
 
 		 630 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1145 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 1101 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 		 488 aa  49.3  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00134459  hitchhiker  0.00520721 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 595 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 		 846 aa  49.3  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 503 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1116  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 707 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  31.25 
 
 		 676 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  26.28 
 
 		 1041 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 902 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1627  histidine kinase  33.07 
 
 		 538 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 1070 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0307  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.83 
 
 		 789 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0739851  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0301  aerobic respiration control sensor protein ArcB  26.83 
 
 		 789 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0737861  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0469  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.38 
 
 		 778 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.55831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.38 
 
 		 778 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0807351  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  22.91 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 914 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 1713 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280335  normal  0.123564 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4372  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 475 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1567  sensory transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 855 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0218  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 855 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.227193  normal  0.9118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.88 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 1356 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 524 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  28.46 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 944 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3175  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 370 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.768346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1126  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.38 
 
 		 778 aa  48.1  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 873 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4342  aerobic respiration control sensor protein ArcB  25.38 
 
 		 779 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 735 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403569  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2327  ATP-binding region ATPase domain protein  26.92 
 
 		 758 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  28.89 
 
 		 661 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3789  aerobic respiration control sensor protein ArcB  27.64 
 
 		 779 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00874982  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  29.01 
 
 		 896 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 977 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  27.73 
 
 		 484 aa  47.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  28.97 
 
 		 616 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 614 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.17 
 
 		 1398 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>