121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2207 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2207  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  705    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 		 507 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00233436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 		 503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1038  hypothetical protein  27.86 
 
 		 523 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00793798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1584  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.42 
 
 		 519 aa  94  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1837  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.17 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631185 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.94 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.67 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1676  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.48 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 307 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5494  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.13 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0199  hypothetical protein  36.47 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.65 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.09 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3737  NADH dehydrogenase  35.29 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.288709  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 326 aa  52.8  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0127971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  32.94 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0177  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.440205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0494  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  26.26 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.346863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.29 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0898  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.61 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.760567  normal  0.885082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2555  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.134819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.29 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3173  UDP-galactose 4-epimerase, putative  25 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.76 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2441  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.31 
 
 		 333 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.989614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.58 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2220  Male sterility-like protein  28.57 
 
 		 306 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589015  normal  0.345847 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4317  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191598  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0107  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.41 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.9 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3563  NmrA-like  25.77 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2899  NADH dehydrogenase  36.05 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328837  normal  0.117785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0755  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  24.21 
 
 		 389 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2324  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.6 
 
 		 297 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.780097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0385  NADH dehydrogenase subunit, putative  29.36 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  22.65 
 
 		 337 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 		 311 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.67 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.00000000841547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4323  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.78 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0087  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase protein  32.18 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  31.78 
 
 		 701 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.97 
 
 		 357 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.42 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.77425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.71 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.43 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3414  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  23.66 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00746  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14210)  23.64 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 		 305 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.27 
 
 		 301 aa  46.6  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  21.58 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.932671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1691  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  23.63 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0053937  hitchhiker  0.000000612217 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.13 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08611  hypothetical protein  23.75 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0698127  hitchhiker  0.000145998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  22.6 
 
 		 668 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2639  UDP-glucose 4-epimerase  26.46 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0539  hypothetical protein  30.37 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0024  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.93 
 
 		 289 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3340  NADH dehydrogenase  32.89 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03119  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12770)  25.93 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1041  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  21.32 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4054  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.46 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856106  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.851831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0793  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein  24.73 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  24.23 
 
 		 665 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0980  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase  21.32 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.687755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.53 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 		 229 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3663  NADH dehydrogenase  32.89 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0046  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  21.72 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25 
 
 		 252 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.21 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.72 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1998  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.68 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2339  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 		 334 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370756  normal  0.0889477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1007  NADH dehydrogenase  29.52 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3730  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.81 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0206  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.7 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0842718  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3407  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.56 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5166  UDP-glucose 4-epimerase  24.48 
 
 		 336 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.500566 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>