More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2163 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2163  stationary phase survival protein SurE  100 
 
 		 256 aa  528  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3515  stationary phase survival protein SurE  42.62 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0474  stationary phase survival protein SurE  39.43 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.122396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7059  stationary phase survival protein SurE  40.23 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2041  stationary phase survival protein SurE  38.62 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.61343 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1351  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1841  stationary phase survival protein SurE  36.76 
 
 		 257 aa  181  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0361  stationary phase survival protein SurE  37.75 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.228867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0932  stationary phase survival protein SurE  39.6 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147904  normal  0.032325 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1665  stationary-phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04835  putative stationary-phase survival acid phosphatase  40.08 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2034  stationary phase survival protein SurE  36.29 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2386  stationary phase survival protein SurE  35.48 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1429  stationary phase survival protein SurE  37.94 
 
 		 259 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0291  stationary phase survival protein SurE  36.69 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0401  stationary phase survival protein SurE  35.08 
 
 		 258 aa  168  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.341473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2737  stationary phase survival protein SurE  39.52 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0137541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0596  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1585  stationary phase survival protein SurE  35.22 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1101  stationary-phase survival protein SurE  36.61 
 
 		 257 aa  161  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.301584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0059  stationary phase survival protein SurE  35.41 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2475  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0732912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3639  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002513  5'-nucleotidase SurE  37.79 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1419  stationary phase survival protein SurE  39.92 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000226907  normal  0.552131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03520  stationary phase survival protein SurE  36.98 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1087  stationary phase survival protein SurE  36.86 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00111349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1365  stationary-phase survival protein SurE  33.98 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0470914 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1399  stationary-phase survival protein SurE  38.37 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.964234  normal  0.440968 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0628  stationary-phase survival protein SurE  39.13 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0468  acid phosphatase SurE  39.13 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1458  stationary phase survival protein SurE  42.17 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1074  stationary-phase survival protein SurE  35.22 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0431532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0091  stationary-phase survival protein SurE  38.04 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1426  stationary phase survival protein SurE  37.96 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000798765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3028  stationary phase survival protein SurE  34.92 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0836  stationary phase survival protein SurE  36.55 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2619  stationary phase survival protein SurE  35.74 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0154858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3481  stationary phase survival protein SurE  34.48 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1129  stationary phase survival protein SurE  37.25 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000434367  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1500  stationary phase survival protein SurE  37.35 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.298521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1523  stationary phase survival protein SurE  38.8 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00581861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2340  exopolyphosphatase / 3'-nucleotidase / 5'-nucleotidase  35.57 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14321  stationary phase survival protein SurE  32.82 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.34395  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1245  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3017  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.456176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0325  stationary phase survival protein SurE  35.02 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1150  acid phosphatase  35.54 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0356696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1245  stationary phase survival protein SurE  38.13 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1167  stationary phase survival protein SurE  36.03 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000789201  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1955  stationary-phase survival protein SurE  37.05 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13151  stationary phase survival protein SurE  37.67 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.146893  normal  0.400321 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1365  stationary phase survival protein SurE  31.54 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1201  stationary phase survival protein SurE  37.8 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00673461  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1144  stationary phase survival protein SurE  35.8 
 
 		 260 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1829  stationary phase survival protein SurE  38.52 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2509  stationary phase survival protein SurE  37.15 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2752  stationary phase survival protein SurE  36.61 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1288  stationary-phase survival protein SurE  38.06 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02594  acid phosphatase  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0944  stationary-phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0869526  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2869  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2882  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02559  hypothetical protein  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3995  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1598  stationary-phase survival protein SurE  36.44 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.520429  unclonable  1.7975500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3045  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0968  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1169  stationary phase survival protein SurE  35.63 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3130  stationary phase survival protein SurE  38.19 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0546  stationary-phase survival protein SurE  36.96 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1121  stationary phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3296  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3428  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0539534  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14561  stationary phase survival protein SurE  31.03 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.934406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0961  stationary phase survival protein SurE  37.5 
 
 		 254 aa  139  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1120  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1191  stationary phase survival protein SurE  35.43 
 
 		 249 aa  139  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0789  stationary phase survival protein SurE  37.07 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1761  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1734  stationary phase survival protein SurE  34.13 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325434  normal  0.0873684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6256  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1823  stationary phase survival protein SurE  34.25 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0899  stationary phase survival protein SurE  35.5 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14701  stationary phase survival protein SurE  31.75 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3215  stationary phase survival protein SurE  37.11 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.25562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0675  stationary-phase survival protein SurE  35.83 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.195262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0199  stationary-phase survival protein SurE  33.21 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.231143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1057  stationary phase survival protein SurE  38.43 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0317  stationary phase survival protein SurE  32.42 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0339  stationary phase survival protein SurE  32.42 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.726536  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1231  stationary phase survival protein SurE  34 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.195993  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2223  stationary phase survival protein SurE  35.66 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97265  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16901  stationary phase survival protein SurE  32.82 
 
 		 262 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.256333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1847  stationary phase survival protein SurE  33.46 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373951  normal  0.144799 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2368  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.977687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2239  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0329592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3435  stationary phase survival protein SurE  35.57 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2201  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0050  stationary phase survival protein SurE  35.37 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>