More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5333 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2198  SOS-response transcriptional repressor, LexA  67.17 
 
 
201 aa  281  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2248  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.7 
 
 
200 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0496433  normal  0.289042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2186  SOS-response transcriptional repressor, LexA  69.7 
 
 
200 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  66.67 
 
 
200 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1233  SOS-response transcriptional repressor, LexA  60.98 
 
 
209 aa  263  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0384913  normal  0.224012 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  56.06 
 
 
202 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.220782 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.05 
 
 
205 aa  234  6e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16801  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.56 
 
 
202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0828  SOS function regulatory protein, LexA repressor  55.56 
 
 
202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0929  LexA repressor  54.5 
 
 
207 aa  232  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  53.54 
 
 
210 aa  231  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1481  peptidase S24, LexA repressor  53.5 
 
 
207 aa  226  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.939319  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19141  SOS function regulatory protein, LexA repressor  53.06 
 
 
198 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.212915 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  51.01 
 
 
205 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1356  SOS function regulatory protein, LexA repressor  51.78 
 
 
205 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0581  LexA repressor  35.35 
 
 
210 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.640194  normal  0.502915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.95 
 
 
201 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  35.96 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1207  transcriptional repressor, LexA family  34.48 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000325213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1002  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.96 
 
 
215 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1237  LexA family transcriptional regulator  35.89 
 
 
205 aa  112  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  33.97 
 
 
223 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36 
 
 
206 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  34.45 
 
 
206 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2243  LexA repressor  36.31 
 
 
198 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  33.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  33.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  33.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  33.97 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  33.97 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  33.97 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  33.97 
 
 
269 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  33.97 
 
 
269 aa  111  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  33.82 
 
 
204 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  33.49 
 
 
207 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1617  LexA repressor  32.35 
 
 
203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1184  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.48 
 
 
199 aa  108  6e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0151  LexA family transcriptional regulator  35.05 
 
 
214 aa  107  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0909  LexA repressor  32.86 
 
 
206 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1364  LexA repressor  32.84 
 
 
203 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000105475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1177  LexA repressor  33.17 
 
 
203 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000269483  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2118  LexA repressor  32.56 
 
 
207 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11470  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.9 
 
 
207 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.7722e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0757  SOS-response transcriptional repressor, LexA  34.33 
 
 
196 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  33.83 
 
 
197 aa  105  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1120  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.41 
 
 
205 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.430548  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1400  LexA repressor  32.23 
 
 
207 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00035573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1427  LexA repressor  32.23 
 
 
207 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000910352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1495  LexA repressor  33.66 
 
 
222 aa  105  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000262911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1543  transcriptional repressor, LexA family  34.98 
 
 
205 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1868  LexA repressor  34.98 
 
 
205 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03915  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.499421  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3950  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4283  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3985  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.359891 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4554  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03875  hypothetical protein  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.453972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4596  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4505  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5524  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194949  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1439  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.15 
 
 
201 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0234  LexA family transcriptional regulator  34.62 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0427  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.38 
 
 
243 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000783758  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
197 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  34.98 
 
 
207 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0773  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.99 
 
 
213 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000913387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.68 
 
 
200 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4579  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4429  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000308575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4494  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0793  SOS-response transcriptional repressor, LexA  35.82 
 
 
198 aa  102  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4631  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.381765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4580  LexA repressor  32.84 
 
 
202 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.285079 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0770  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.66 
 
 
217 aa  100  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.953907  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.02 
 
 
201 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1693  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.58 
 
 
215 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.026271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3234  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.33 
 
 
216 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2741  LexA repressor  34.63 
 
 
205 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  31.19 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3152  LexA repressor  33.98 
 
 
205 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0247  LexA repressor  32.34 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0945075  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0514  LexA repressor  32.2 
 
 
202 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3770  LexA repressor  33.17 
 
 
202 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.638288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4460  LexA repressor  33.17 
 
 
202 aa  99  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3094  LexA repressor  31.14 
 
 
228 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.561112 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1300  LexA repressor  33.17 
 
 
202 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2297  LexA repressor  33 
 
 
202 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0763769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3860  LexA repressor  33.17 
 
 
202 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1579  transcriptional repressor, LexA family  33.66 
 
 
202 aa  99  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  32.2 
 
 
202 aa  99  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0237  LexA repressor  32.84 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0532878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2601  LexA repressor  34.15 
 
 
205 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.51 
 
 
204 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  33.33 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1008  repressor lexA  31.68 
 
 
204 aa  98.2  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000183008  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10800  SOS regulatory protein LexA  32.29 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  unclonable  0.0000000017839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  34.63 
 
 
202 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  33.66 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2152  peptidase S24, LexA repressor  35.71 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0120342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>