More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2849 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
545 aa  666    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  59.63 
 
 
549 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  61.85 
 
 
543 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
545 aa  668    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
539 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  63.15 
 
 
542 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  81.59 
 
 
555 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  62.1 
 
 
544 aa  670    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  74.48 
 
 
553 aa  784    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
542 aa  661    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  77.53 
 
 
576 aa  807    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
544 aa  660    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
544 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
544 aa  662    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  81.59 
 
 
555 aa  855    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
543 aa  663    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1783  chaperonin GroEL  63.38 
 
 
560 aa  654    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  60.77 
 
 
541 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  63.07 
 
 
539 aa  669    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  60.73 
 
 
545 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  64.27 
 
 
544 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  78.61 
 
 
560 aa  819    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  61.99 
 
 
545 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  61.91 
 
 
544 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1747  chaperonin GroEL  61.3 
 
 
562 aa  650    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0615  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
559 aa  663    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  61.73 
 
 
544 aa  658    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  64.6 
 
 
541 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
544 aa  660    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
544 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  61.76 
 
 
545 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  69.04 
 
 
555 aa  757    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  63.71 
 
 
544 aa  676    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05061  chaperonin GroEL  63 
 
 
563 aa  651    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  63.4 
 
 
538 aa  674    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
544 aa  649    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.41 
 
 
539 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
536 aa  641    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  62.17 
 
 
538 aa  651    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  65.41 
 
 
543 aa  690    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  64.6 
 
 
541 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  62.25 
 
 
544 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  59.63 
 
 
553 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  61.1 
 
 
545 aa  637    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
541 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06501  chaperonin GroEL  62.03 
 
 
564 aa  659    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  77.26 
 
 
561 aa  818    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  63.76 
 
 
544 aa  676    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  62.57 
 
 
543 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  62.92 
 
 
538 aa  662    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04501  chaperonin GroEL  61.6 
 
 
565 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.383214  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  100 
 
 
556 aa  1090    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  63.36 
 
 
544 aa  662    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
544 aa  664    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  63.2 
 
 
539 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  62.8 
 
 
544 aa  662    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  62.81 
 
 
547 aa  645    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  62.5 
 
 
544 aa  645    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  59.66 
 
 
543 aa  640    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  64.14 
 
 
547 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  62.36 
 
 
542 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  59.01 
 
 
540 aa  632  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  59.41 
 
 
545 aa  632  1e-180  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2573  chaperonin GroEL  59.33 
 
 
539 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2275  chaperonin GroEL  59.7 
 
 
539 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  61.36 
 
 
546 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  62.64 
 
 
539 aa  632  1e-180  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
541 aa  631  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  59.17 
 
 
544 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1846  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
540 aa  629  1e-179  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  62.01 
 
 
540 aa  631  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  59.89 
 
 
546 aa  628  1e-179  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  59.92 
 
 
554 aa  628  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  61.52 
 
 
539 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  60.56 
 
 
541 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
540 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.65 
 
 
554 aa  628  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0884  chaperonin, 60 kDa  60 
 
 
547 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000145695  hitchhiker  0.0000472619 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1396  chaperonin GroEL  58.67 
 
 
541 aa  626  1e-178  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.359788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.37 
 
 
540 aa  625  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  58.41 
 
 
548 aa  623  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  61.55 
 
 
540 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  58.68 
 
 
546 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  59.63 
 
 
540 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.28 
 
 
547 aa  623  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  58.93 
 
 
544 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2503  chaperonin GroEL  58.19 
 
 
549 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45914  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1500  chaperonin GroEL  59.04 
 
 
540 aa  621  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.233248  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
541 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
541 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  58.9 
 
 
547 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  59.67 
 
 
539 aa  622  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0224  chaperonin GroEL  58.26 
 
 
536 aa  624  1e-177  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.957356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  60 
 
 
542 aa  624  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  61.36 
 
 
540 aa  622  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
541 aa  621  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  58.54 
 
 
547 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  58.83 
 
 
543 aa  620  1e-176  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  59.78 
 
 
538 aa  618  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>