More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0615 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  61.58 
 
 
576 aa  669    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1783  chaperonin GroEL  76.32 
 
 
560 aa  828    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
560 aa  660    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05061  chaperonin GroEL  76.13 
 
 
563 aa  827    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.125633 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1747  chaperonin GroEL  88.39 
 
 
562 aa  943    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0615  chaperonin GroEL  100 
 
 
559 aa  1104    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0451  chaperonin GroEL  63.83 
 
 
584 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.393151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  66.29 
 
 
555 aa  700    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04761  chaperonin GroEL  63.98 
 
 
581 aa  697    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04501  chaperonin GroEL  78.88 
 
 
565 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.383214  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06501  chaperonin GroEL  80.34 
 
 
564 aa  862    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
555 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  63.79 
 
 
556 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05071  chaperonin GroEL  64.02 
 
 
581 aa  691    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  62.55 
 
 
553 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  61.96 
 
 
561 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05141  chaperonin GroEL  63.23 
 
 
587 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.351997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  64.07 
 
 
555 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  60.41 
 
 
542 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  60.04 
 
 
543 aa  614  9.999999999999999e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  58.57 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  58.57 
 
 
541 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  59.28 
 
 
544 aa  612  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
544 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
544 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
544 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
544 aa  610  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
544 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  58.43 
 
 
544 aa  609  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  58.76 
 
 
544 aa  608  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  56.47 
 
 
544 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  57.01 
 
 
538 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
544 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
544 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  58 
 
 
542 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  57.55 
 
 
539 aa  610  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  58.41 
 
 
538 aa  605  9.999999999999999e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2074  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
540 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.169869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  59.28 
 
 
544 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  58.5 
 
 
539 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  58.95 
 
 
542 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  56.51 
 
 
543 aa  604  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  57.49 
 
 
544 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  58.14 
 
 
544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  57.77 
 
 
545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  55.66 
 
 
545 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  57.49 
 
 
544 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  58.37 
 
 
547 aa  598  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  55.76 
 
 
545 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
541 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  58.02 
 
 
539 aa  600  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
541 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  55.83 
 
 
545 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  57.71 
 
 
544 aa  600  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  56.46 
 
 
543 aa  601  1e-170  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  58.61 
 
 
541 aa  600  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  57.12 
 
 
543 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  57.5 
 
 
543 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6245  chaperonin GroEL  54.26 
 
 
544 aa  596  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0444  chaperonin GroEL  57.77 
 
 
544 aa  594  1e-168  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2113  chaperonin GroEL  56.48 
 
 
542 aa  594  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0162  chaperonin GroEL  57.61 
 
 
543 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.762857  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2079  chaperonin GroEL  56.61 
 
 
539 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131312  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  58 
 
 
549 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0392  chaperonin GroEL  55.24 
 
 
543 aa  592  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  57.51 
 
 
541 aa  594  1e-168  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  57.14 
 
 
541 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  57.3 
 
 
540 aa  588  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3702  chaperonin GroEL  57.33 
 
 
540 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0706  chaperonin GroEL  58.35 
 
 
541 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.27717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  57.14 
 
 
541 aa  589  1e-167  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3034  chaperonin GroEL  56.32 
 
 
540 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  55.87 
 
 
545 aa  585  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  55.99 
 
 
538 aa  585  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  55.41 
 
 
550 aa  585  1e-166  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  58.03 
 
 
545 aa  587  1e-166  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  57.79 
 
 
536 aa  585  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0052  chaperonin GroEL  55.72 
 
 
539 aa  588  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00947339  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5038  chaperonin GroEL  56.65 
 
 
542 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.473372  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  57.17 
 
 
547 aa  585  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  55.99 
 
 
538 aa  585  1e-166  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0985  chaperonin GroEL  56.12 
 
 
547 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1762  chaperonin GroEL  56.15 
 
 
539 aa  587  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0413105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  55.58 
 
 
540 aa  585  1e-166  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4025  chaperonin GroEL  57.98 
 
 
536 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  56.19 
 
 
540 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3982  chaperonin GroEL  57.59 
 
 
541 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  57.38 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0269  chaperonin GroEL  58.3 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00058444 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5849  chaperonin GroEL  56.46 
 
 
542 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471391  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  56.23 
 
 
541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  56.26 
 
 
544 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2311  chaperonin GroEL  55.93 
 
 
547 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0587  chaperonin GroEL  57.01 
 
 
548 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  55.89 
 
 
541 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0814  chaperonin GroEL  57.28 
 
 
540 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000301367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0311  chaperonin GroEL  58.49 
 
 
540 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000447633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  54.86 
 
 
538 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  57.41 
 
 
539 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>