72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2691 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2691  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 		 271 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3082  MltA-interacting MipA  39.03 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  43.04 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  39.62 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04838  outer membrane protein V  42.99 
 
 		 223 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  33.21 
 
 		 278 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  32.71 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3065  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.661828  normal  0.57248 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0935  mipA family protein  31.22 
 
 		 248 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2260  MipA family MltA-interacting protein  30.8 
 
 		 259 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1353  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.376452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1335  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051993 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0097  hypothetical protein  30.38 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1020  mipA family protein  30.38 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.523681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1516  mipA family protein  30.38 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0671377  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0872  MltA-interacting MipA  30.8 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1143  hypothetical protein  30.38 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1237  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.355193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4495  MltA-interacting MipA  29.91 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1262  MltA-interacting MipA family protein  30.8 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1738  MipA family MltA-interacting protein  28.45 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.129336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3501  MltA-interacting protein MipA  28.45 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.97592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  27.68 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3144  MltA-interacting MipA family protein  26.09 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3721  phosphate ABC transporter permease  21.65 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5596  putative outer membrane lytic transglycosylase MltA-interacting MipA  26.34 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  24.89 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  25.26 
 
 		 275 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5264  MltA-interacting MipA family protein  24.79 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2284  putative transmembrane protein  30.95 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0793  MltA-interacting MipA  26.5 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  24.07 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5565  MltA-interacting MipA family protein  24.44 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5393  MltA-interacting MipA family protein  23.36 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11374  decreased coverage  0.00715974 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1413  MltA-interacting MipA family protein  24.55 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2966  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602503  hitchhiker  0.00558879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3115  MltA-interacting MipA  24.1 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  34.52 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1632  outer membrane protein  22.54 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.344859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1214  hypothetical protein  22.04 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.696936  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2088  MltA-interacting MipA family protein  25.42 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.928938 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3385  MltA-interacting MipA family protein  23.83 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  30.95 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2482  MltA-interacting MipA family protein  25.42 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.198276 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  33.33 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  23.95 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2703  MltA-interacting MipA family protein  24.07 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  21.37 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  32.33 
 
 		 491 aa  52.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  27.82 
 
 		 497 aa  49.7  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4266  MltA-interacting MipA family protein  23.24 
 
 		 292 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0473708  normal  0.157448 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3799  MltA-interacting MipA family protein  23.24 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.982495  normal  0.465429 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3980  MltA-interacting MipA  22.82 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4387  MltA-interacting MipA family protein  22.82 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.854109  normal  0.685584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4235  MltA-interacting MipA family protein  22.82 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0709487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5968  MltA-interacting MipA family protein  22.41 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  21.91 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5533  hypothetical protein  26.97 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  32.95 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2290  MipA family MltA-interacting protein  23.24 
 
 		 298 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3126  mipA family protein  23.24 
 
 		 378 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0524278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  31.82 
 
 		 255 aa  45.8  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3000  MltA-interacting protein MipA  23.24 
 
 		 378 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0210905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2094  MltA-interacting MipA  33.68 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  37.8 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1423  MltA-interacting MipA family protein  22.84 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.409718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  37.35 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  30.14 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4161  MltA-interacting MipA family protein  26.92 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0570636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  34.57 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  23.86 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  25.95 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>