115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4564 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  100 
 
 		 497 aa  1012    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  80.8 
 
 		 491 aa  754    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02508  hypothetical protein  26.64 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0649  MltA-interacting MipA family protein  25.29 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0235984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003551  hypothetical protein  26.82 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0775  MltA-interacting MipA family protein  25.22 
 
 		 454 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2535  hypothetical protein  25.35 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0449668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3808  hypothetical protein  24.39 
 
 		 460 aa  126  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  31.22 
 
 		 250 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  27.13 
 
 		 259 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3546  hypothetical protein  37.18 
 
 		 212 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0041915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1171  MltA-interacting MipA  31.02 
 
 		 256 aa  89.7  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.731654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  29.15 
 
 		 267 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  28.43 
 
 		 270 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  24.43 
 
 		 263 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  26.58 
 
 		 244 aa  87.4  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  25 
 
 		 259 aa  87  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  27.88 
 
 		 256 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  27.88 
 
 		 273 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  27.88 
 
 		 256 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  29.53 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  27.45 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  29.57 
 
 		 250 aa  80.9  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  30.04 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  29.6 
 
 		 271 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  26.8 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  26.52 
 
 		 282 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  24.23 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  26.91 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  26.91 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.215527 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  29.78 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  29.41 
 
 		 249 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  26.44 
 
 		 255 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  26.91 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  26.91 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  26.91 
 
 		 248 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  27.21 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  27.21 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  26.22 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  30.61 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  34 
 
 		 270 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  25.69 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  30.41 
 
 		 288 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  28.47 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  28.57 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  25.65 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  29.27 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  24.12 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  23.68 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  23.68 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  23.68 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  27.48 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  23.68 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  26.34 
 
 		 247 aa  69.3  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 292 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  25.65 
 
 		 248 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  23.25 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  28.25 
 
 		 272 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  30.2 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  23.25 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 287 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 304 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  26.98 
 
 		 287 aa  67  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  26.55 
 
 		 246 aa  66.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  26.15 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  25.82 
 
 		 250 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.57 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 257 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  25.4 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  26.67 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  24.07 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  26.15 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  28.31 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  24.61 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  28.19 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  20.89 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1321  hypothetical protein  28.42 
 
 		 216 aa  57  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4756  putative outer membrane protein  28.63 
 
 		 308 aa  57  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.290345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  23.71 
 
 		 257 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2029  MltA-interacting MipA family protein  25.62 
 
 		 284 aa  53.5  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.221941  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4508  MltA-interacting MipA  32.63 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.600654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  26.84 
 
 		 272 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  34.74 
 
 		 225 aa  51.6  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3503  MltA-interacting MipA family protein  23.83 
 
 		 279 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0821  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 		 280 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0134588  hitchhiker  0.0000215759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3202  MltA-interacting MipA family protein  26.24 
 
 		 280 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.118328  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  23.64 
 
 		 281 aa  50.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0842  MltA-interacting MipA family protein  23.6 
 
 		 281 aa  50.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00913257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>