127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1962 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1962  MltA-interacting MipA family protein  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2258  MltA-interacting MipA family protein  95.58 
 
 
249 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2218  MltA-interacting MipA family protein  64.66 
 
 
249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1976  MltA-interacting MipA family protein  56.63 
 
 
249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2730  MltA-interacting MipA family protein  56.63 
 
 
254 aa  294  7e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  hitchhiker  0.000331014 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1990  MltA-interacting protein  56.1 
 
 
256 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000189285  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2353  hypothetical protein  56.1 
 
 
273 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000266286  normal  0.096147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2098  MltA-interacting MipA family protein  56.1 
 
 
256 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1413  MltA-interacting protein  53.82 
 
 
248 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  normal  0.558802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1889  MltA-interacting protein  53.82 
 
 
248 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.310283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2070  MltA-interacting protein  53.82 
 
 
248 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000515947 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1397  MltA-interacting protein  53.41 
 
 
274 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1380  MltA-interacting protein  53.41 
 
 
274 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.215527 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01751  scaffolding protein for murein synthesizing machinery  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.910835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1860  MltA-interacting MipA family protein  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1867  MltA-interacting protein MipA  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00884269  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2006  MltA-interacting protein MipA  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.666046  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01739  hypothetical protein  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.923789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1850  MltA-interacting MipA family protein  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.112768  hitchhiker  0.0014018 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1409  MltA-interacting protein MipA  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.543769  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2030  MltA-interacting protein MipA  53.82 
 
 
248 aa  274  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2506  MltA-interacting protein MipA  53.82 
 
 
248 aa  272  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0237592  normal  0.810887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1672  MltA-interacting MipA family protein  55.69 
 
 
248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.594604  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3701  MltA-interacting MipA family protein  47.39 
 
 
250 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0145  MltA-interacting MipA family protein  40.49 
 
 
246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3910  MltA-interacting protein MipA  42.24 
 
 
246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.709992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4953  MltA-interacting protein MipA  41.81 
 
 
246 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4081  MltA-interacting protein MipA  41.81 
 
 
246 aa  196  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0129  MltA-interacting MipA family protein  41.81 
 
 
246 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.862546  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03439  hypothetical protein  41.81 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03390  hypothetical protein  41.81 
 
 
246 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0125  MltA-interacting MipA family protein  41.81 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3788  MltA-interacting protein MipA  41.81 
 
 
246 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1684  MltA-interacting MipA family protein  35.56 
 
 
263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1656  putative outer membrane protein/scaffolding protein MipA  33.06 
 
 
270 aa  129  6e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0234795  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2376  MltA-interacting MipA  34.6 
 
 
259 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.487283  normal  0.1296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0478  MltA-interacting MipA family protein  36.82 
 
 
272 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2644  MltA-interacting protein  34.98 
 
 
259 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158606  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1891  MltA-interacting MipA  32.65 
 
 
270 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0905177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1090  MltA-interacting MipA family protein  29.67 
 
 
250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2146  putative MltA-interacting protein MipA  28.74 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0292974  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1392  MltA-interacting MipA family protein  28.76 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.212014  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3466  MltA-interacting MipA family protein  29.75 
 
 
244 aa  94.4  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3708  MltA-interacting MipA family protein  30.23 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2586  scaffolding protein for murein-synthesizing holoenzyme putative outermembrane protein  30.16 
 
 
245 aa  88.6  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06020  hypothetical protein  30 
 
 
211 aa  88.2  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3166  MltA-interacting MipA family protein  31.49 
 
 
257 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0454156  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0936  outer membrane protein OmpV  27.13 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0240452  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3818  MltA-interacting MipA family protein  29.84 
 
 
491 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.217348  normal  0.980819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4564  MltA-interacting MipA  29.41 
 
 
497 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.672306  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0808  MltA-interacting MipA family protein  27.94 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.121594  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0898  MltA-interacting MipA family protein  30.68 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436193  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1032  MltA-interacting MipA family protein  31.76 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000317103  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3569  MltA-interacting MipA  22.84 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000215128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0983  MltA-interacting MipA family protein  23.74 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175299  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2639  MltA-interacting MipA family protein  27.97 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3004  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000564668  normal  0.120239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3592  hypothetical protein  24.21 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3085  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00416947  normal  0.497411 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0162  MltA-interacting MipA family protein  27.47 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2733  outer membrane protein  28.25 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.244653  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3182  MltA-interacting MipA family protein  23.81 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0446172  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2702  MltA-interacting MipA family protein  28.62 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3975  MltA-interacting MipA family protein  25.93 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.859945  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3498  MltA-interacting MipA family protein  25.94 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.605906  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0589  MltA-interacting MipA family protein  30.83 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3687  MltA-interacting MipA family protein  25.94 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645543  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2798  putative outer membrane protein  34.31 
 
 
294 aa  62.4  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0453163  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1860  MltA-interacting MipA family protein  27.45 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.273138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1012  MltA-interacting MipA family protein  26 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00934718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0880  MltA-interacting MipA family protein  26.49 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0870258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0351  MltA-interacting MipA  33.33 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.2595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3058  MltA-interacting MipA family protein  26.87 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3285  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011274  normal  0.15127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1073  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
287 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1106  MltA-interacting MipA family protein  27.81 
 
 
304 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.374888  normal  0.0229825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0752  MltA-interacting MipA family protein  25.19 
 
 
257 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0638189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3566  MltA-interacting MipA family protein  25.19 
 
 
257 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119628  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0410  MltA-interacting MipA family protein  28.26 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000689  outer membrane protein OmpV  24.91 
 
 
258 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.419049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1004  MltA-interacting MipA family protein  27.15 
 
 
268 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3319  MltA-interacting MipA  42.67 
 
 
278 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3134  MltA-interacting MipA family protein  40 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2564  MltA-interacting MipA family protein  31.74 
 
 
270 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.295331  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3404  MltA-interacting MipA  26.45 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1315  MltA-interacting MipA  29.13 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00759705  normal  0.297084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0683  hypothetical protein  26.8 
 
 
318 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0548  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 
327 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000364413  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0847  MltA-interacting MipA family protein  24.34 
 
 
257 aa  55.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0974591  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1099  hypothetical protein  26.51 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2450  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase HemN  23.66 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.846103  normal  0.839506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4081  MltA-interacting MipA family protein  27.83 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1813  putative exported (scaffolding) protein  24.81 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236037  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3438  MltA-interacting MipA family protein  28.26 
 
 
271 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2697  hypothetical protein  23.89 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.371809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0561  MltA-interacting MipA  25.65 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.711283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1081  MltA-interacting MipA family protein  25.41 
 
 
282 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0464933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03124  hypothetical protein  24.77 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1724  hypothetical protein  26.41 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3226  MltA-interacting MipA family protein  30.34 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>