79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1094 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  100 
 
 		 272 aa  550  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  93.73 
 
 		 272 aa  489  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  67.9 
 
 		 270 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  61.28 
 
 		 267 aa  343  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  63.64 
 
 		 275 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  63.02 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  63.02 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  62.88 
 
 		 269 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  54.58 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  53.26 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  53.26 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  52.85 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  53.26 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  53.26 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  55.92 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  55.92 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  55.92 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  55.92 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  53.26 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  53.26 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  52.49 
 
 		 264 aa  271  6e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  52.49 
 
 		 264 aa  271  9e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  52.11 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  35.59 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  31.29 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  29.56 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  26.09 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  28.67 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  26.19 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  25.4 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  28.65 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  25.2 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  27.07 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.51 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  24.05 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2309  hypothetical protein  26.79 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  20.47 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0983  GumN family protein  26.42 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.69 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  26.03 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  26.03 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  26.03 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  24.91 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  26.25 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  23.51 
 
 		 310 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1616  GumN  24.73 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.545787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5855  GumN family protein  26.34 
 
 		 352 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2113  GumN  23.92 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2191  GumN family protein  25.38 
 
 		 328 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  23.08 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  27.96 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  26.74 
 
 		 323 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  23.33 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  26.71 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  26.71 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  24.22 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  26.71 
 
 		 298 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  22.3 
 
 		 353 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  22.49 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  21.77 
 
 		 356 aa  48.9  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  21.8 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  20.25 
 
 		 252 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  22.89 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4133  GumN family protein  25.3 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.528275 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4245  GumN family protein  25.3 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3402  GumN  22.9 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.697467  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2340  hypothetical protein  23.67 
 
 		 328 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.868577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3961  GumN family protein  24.03 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  21.32 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  23.85 
 
 		 381 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  23.85 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  22.66 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2380  GumN family protein  27.16 
 
 		 340 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.538777 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  23.85 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  23.85 
 
 		 381 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  25.62 
 
 		 381 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  25.62 
 
 		 381 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  25.4 
 
 		 401 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>