More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_45440  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3857  hypothetical protein  79.92 
 
 
243 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3460  protein of unknown function DUF152  36.14 
 
 
264 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3397  protein of unknown function DUF152  36.14 
 
 
264 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.97667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  31.09 
 
 
294 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2821  hypothetical protein  29.66 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000917189  decreased coverage  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  31.88 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1419  hypothetical protein  32.42 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2759  hypothetical protein  31.92 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.291456  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  32.47 
 
 
256 aa  89  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  31.6 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0281  hypothetical protein  30.12 
 
 
265 aa  88.6  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3434  hypothetical protein  31.62 
 
 
266 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3353  hypothetical protein  32.26 
 
 
278 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.0000198668  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  30.04 
 
 
262 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3616  hypothetical protein  32.57 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.192743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0882  hypothetical protein  30.67 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  31.12 
 
 
264 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1661  hypothetical protein  36.3 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000830855  normal  0.376389 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2473  hypothetical protein  36.3 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0424084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2377  hypothetical protein  36.3 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.52116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3109  protein of unknown function DUF152  32.51 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.158574 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2883  hypothetical protein  32.02 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0393736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  30.2 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3006  protein of unknown function DUF152  32.02 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4846  protein of unknown function DUF152  28.84 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2760  protein of unknown function DUF152  30.96 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5410  hypothetical protein  31.68 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0083  hypothetical protein  32.22 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07731  hypothetical protein  31.06 
 
 
284 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  33.5 
 
 
254 aa  82  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3643  hypothetical protein  28.09 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000406185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3660  hypothetical protein  28.09 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000004457  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5255  protein of unknown function DUF152  33.86 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.76056  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3915  conserved hypothetical protein TIGR00726  28.09 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000173182 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3752  hypothetical protein  27.53 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00471445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4040  hypothetical protein  27.53 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000113065  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05921  hypothetical protein  26.51 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1239  hypothetical protein TIGR00726  29.21 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4002  conserved hypothetical protein TIGR00726  29.21 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019773  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  23.62 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2550  hypothetical protein  31.4 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.810005  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0947  hypothetical protein  32.98 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.398421  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3953  conserved hypothetical protein TIGR00726  27.53 
 
 
272 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3728  hypothetical protein  28.65 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1033  protein of unknown function DUF152  29.91 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000577203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  33.66 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05311  hypothetical protein  25.43 
 
 
260 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.773541  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3946  hypothetical protein  26.55 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000149737  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2769  protein of unknown function DUF152  29.32 
 
 
276 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2550  hypothetical protein  29.05 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0107424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3093  hypothetical protein  32.47 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  32.02 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  23.62 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0258  hypothetical protein  31.03 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.626731 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  32.65 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  31.63 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2304  hypothetical protein  32.71 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  35.38 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3333  protein of unknown function DUF152  29.32 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.586803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3721  hypothetical protein  30.58 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0381859  normal  0.989712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1411  hypothetical protein  27.91 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0881104  normal  0.275348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  35.9 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2949  hypothetical protein  30.43 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0109702  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2169  hypothetical protein  29.7 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0423  hypothetical protein  33.99 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3291  hypothetical protein  32.31 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.613887  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1144  protein of unknown function DUF152  29.06 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570769  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1452  protein of unknown function DUF152  32.77 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000217835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  31.05 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2951  hypothetical protein  27.06 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2397  hypothetical protein  28.16 
 
 
293 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.2259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1313  protein of unknown function DUF152  26.89 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000357358  normal  0.806626 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  27.84 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  27.84 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2502  hypothetical protein  33.16 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.341887  normal  0.521161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  30.1 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3877  hypothetical protein  29.06 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.282753  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0479  hypothetical protein  24.65 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.781754  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1240  protein of unknown function DUF152  22.45 
 
 
237 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0528  hypothetical protein  26.73 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4844  protein of unknown function DUF152  29.06 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10850  conserved hypothetical protein TIGR00726  31.31 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00949972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  28.64 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0724  hypothetical protein  28.21 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  29.33 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4166  hypothetical protein  27.78 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0485  hypothetical protein  39.81 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  31.19 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  30.04 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  30.27 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3610  hypothetical protein  30.29 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.197134  hitchhiker  0.00698537 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0015  hypothetical protein  27.52 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0430923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0346  hypothetical protein  31.16 
 
 
259 aa  72  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1354  hypothetical protein  29.19 
 
 
263 aa  72  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.487707  normal  0.98055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>