More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2377 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2377  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  534  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.52116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2473  hypothetical protein  99.61 
 
 		 257 aa  531  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0424084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1661  hypothetical protein  96.11 
 
 		 251 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000830855  normal  0.376389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2821  hypothetical protein  59.22 
 
 		 238 aa  309  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000917189  decreased coverage  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0668  hypothetical protein  36.16 
 
 		 242 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0278315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2033  protein of unknown function DUF152  39.24 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0223194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2697  hypothetical protein  36.42 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.077705  normal  0.0540588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0239  hypothetical protein  33.77 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.314776  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2773  hypothetical protein  32.91 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000469937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2990  hypothetical protein  32.91 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2878  hypothetical protein  32.91 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.334761 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2876  hypothetical protein  32.91 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2857  hypothetical protein  32.91 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.269162  normal  0.142595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3834  hypothetical protein  35.44 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000211618  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1079  protein of unknown function DUF152  35.44 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000618765  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2974  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  92  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00490626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2879  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  92  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0403842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3524  protein of unknown function DUF152  39.88 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2796  protein of unknown function DUF152  36.02 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2747  hypothetical protein  35.53 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237023  normal  0.160095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1088  hypothetical protein  35.53 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000709492  decreased coverage  0.000000258104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2889  protein of unknown function DUF152  34.78 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0177  protein of unknown function DUF152  32.2 
 
 		 260 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2011  hypothetical protein  34.64 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02483  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02447  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0322362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2751  hypothetical protein  34.87 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000286406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2234  hypothetical protein  34.71 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0665  hypothetical protein  37.41 
 
 		 244 aa  88.6  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00201072  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1293  protein of unknown function DUF152  35.4 
 
 		 262 aa  88.6  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3914  hypothetical protein  32.68 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2703  hypothetical protein  34.78 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1729  hypothetical protein  33.99 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0184349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04872  hypothetical protein  31.98 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3173  hypothetical protein  32.52 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.652021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1488  hypothetical protein  37.91 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01006  hypothetical protein  31.61 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004393  hypothetical protein  30.41 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1285  hypothetical protein  32.68 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1286  hypothetical protein  32.68 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11950  hypothetical protein  33.97 
 
 		 242 aa  85.5  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2033  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1114  hypothetical protein  35.76 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45440  hypothetical protein  36.3 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1977  hypothetical protein  33.91 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1003  hypothetical protein  31.21 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1137  hypothetical protein  32.68 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302517  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4546  hypothetical protein  34.19 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3170  hypothetical protein  31.43 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000013997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1551  hypothetical protein  33.92 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2992  hypothetical protein  29.94 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000583281  normal  0.469772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2651  hypothetical protein  33.13 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.683201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1903  protein of unknown function DUF152  36.13 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0973  hypothetical protein  37.98 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0368  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2111  hypothetical protein  36.13 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.972024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3073  hypothetical protein  32.68 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0206514  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3142  hypothetical protein  32.03 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.643342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1917  hypothetical protein  32.3 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.109207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0856  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0616698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3857  hypothetical protein  32.28 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3158  protein of unknown function DUF152  34.01 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4051  protein of unknown function DUF152  33.93 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1369  hypothetical protein  32.85 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1855  hypothetical protein  32.3 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3213  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000121495  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01441  hypothetical protein  32.72 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3850  protein of unknown function DUF152  34.64 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1605  hypothetical protein  34.42 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0811  hypothetical protein  32.92 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.101718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3350  hypothetical protein  33.77 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0329886  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0432  conserved hypothetical protein TIGR00726  35.48 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0594  protein of unknown function DUF152  35.48 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.135451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1336  hypothetical protein  31.79 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.013723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4103  hypothetical protein  36.51 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1629  hypothetical protein  35.34 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1452  protein of unknown function DUF152  32.09 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000217835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3335  hypothetical protein  30.63 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.466504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3073  hypothetical protein  30.51 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000509857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0670  hypothetical protein  32.93 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2260  hypothetical protein  29.49 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.516462  normal  0.73418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3165  hypothetical protein  30.86 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0488343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1010  protein of unknown function DUF152  38.39 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4835  hypothetical protein  31.9 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22760  conserved hypothetical protein TIGR00726  32.69 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  0.0380699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3578  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2167  hypothetical protein  31.03 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2332  hypothetical protein  31.03 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.736858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3476  hypothetical protein  33.12 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00372273  normal  0.376709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0338  protein of unknown function DUF152  31.72 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000382886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3023  protein of unknown function DUF152  33.33 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1653  hypothetical protein  31.1 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00346479  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2849  hypothetical protein  30.72 
 
 		 241 aa  78.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.698305  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2211  hypothetical protein  33.77 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3498  hypothetical protein  26.32 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.972564  normal  0.0227032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0970  hypothetical protein  32.47 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2550  hypothetical protein  32.1 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2463  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299947 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1013  hypothetical protein  36.3 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0176891 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2712  hypothetical protein  36.72 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.044183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>