More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_43610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2464  AMP-dependent synthetase and ligase  76.58 
 
 		 555 aa  912    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4205  AMP-dependent synthetase and ligase  72.43 
 
 		 551 aa  842    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3656  putative AMP-binding protein  98.56 
 
 		 555 aa  1125    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.330411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43610  putative AMP-binding protein  100 
 
 		 555 aa  1135    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0297438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1090  AMP-dependent synthetase and ligase  55.04 
 
 		 555 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0267  AMP-dependent synthetase and ligase  50.54 
 
 		 563 aa  561  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2888  AMP-dependent synthetase and ligase  50.27 
 
 		 560 aa  531  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0719534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0284  long-chain-fatty-acid-CoA ligase, putative  49.28 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2935  AMP-binding domain-containing protein  48.74 
 
 		 553 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1154  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  48.56 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2479  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 		 559 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2780  AMP-binding domain-containing protein  48.56 
 
 		 598 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0998  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 546 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.231761  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5098  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.183916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01022  AMP-binding protein  45.27 
 
 		 559 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2970  AMP-dependent synthetase and ligase  47.18 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383632  normal  0.0772174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4587  AMP-dependent synthetase and ligase  43.47 
 
 		 551 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000231553  unclonable  0.0000000387525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  43.11 
 
 		 555 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167581 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000026311  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3502  AMP-dependent synthetase and ligase  42.36 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0361  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0349  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 554 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000814911  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0356  AMP-dependent synthetase and ligase  41.33 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1920  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.22 
 
 		 563 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.022094  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3617  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0261  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 551 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000998406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0359  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 554 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00409412  decreased coverage  0.000000000100216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.597598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0355  AMP-binding protein  41.14 
 
 		 554 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03363  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.33 
 
 		 563 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  42.35 
 
 		 547 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3437  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 		 555 aa  432  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.915272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0326  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 554 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  0.942531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 554 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.354824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002639  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.6 
 
 		 563 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.409821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3634  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 		 554 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00109176  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0631  putative AMP-binding acetyl-CoA synthetase  39.2 
 
 		 558 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.365879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0675  AMP-binding protein  38.81 
 
 		 547 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3811  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0982  hypothetical protein  35.58 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1015  hypothetical protein  35.4 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 596 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 607 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000854556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  31.25 
 
 		 610 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1374  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 590 aa  246  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4099  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 623 aa  245  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 597 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000490287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.91 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06190  probable long chain fatty-acid CoA ligase  30.73 
 
 		 592 aa  241  2.9999999999999997e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 605 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  28.22 
 
 		 610 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4936  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 626 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1523  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  31.03 
 
 		 587 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 607 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 616 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1417  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 645 aa  233  6e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000978143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 602 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 602 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 602 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 590 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 		 604 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 608 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3503  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 618 aa  230  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.129901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1708  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 630 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 599 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 592 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710201  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2038  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  32 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0779  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.33 
 
 		 614 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.546194  hitchhiker  0.00265448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2127  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 620 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148266  normal  0.516077 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2458  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 612 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 622 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 597 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 605 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.67 
 
 		 601 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2355  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 610 aa  223  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.295722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 604 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1847  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 609 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1114  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 596 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164574 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0673  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 602 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0141445 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 592 aa  220  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.254378  normal  0.619309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 604 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 603 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000942642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 593 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 599 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 604 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3751  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 647 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28391  normal  0.673702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  26.76 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  29.72 
 
 		 607 aa  217  4e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 633 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 597 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 599 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>