69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_33380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_33380  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.72965  normal  0.084061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2838  hypothetical protein  94.77 
 
 		 306 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32640  hypothetical protein  52.13 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00101125  hitchhiker  0.00152263 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2763  hypothetical protein  51.42 
 
 		 301 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1272  meta-pathway phenol degradation-like protein  45.21 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2732  putative signal peptide  36.42 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235663  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7181  protein involved in meta-pathway of phenol degradation-like  37.5 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0516478 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5489  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like  37.5 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6775  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.5 
 
 		 318 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6363  MetA-pathway-like protein  37.18 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6009  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.18 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6305  protein involved in MetA-pathway of phenol degradation-like protein  37.5 
 
 		 319 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477506  normal  0.244867 
 
 
-
 
NC_003296  RS05192  putative signal peptide protein  35.5 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00268581  normal  0.960066 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2955  meta-pathway phenol degradation-like protein  33.45 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3305  MetA-pathway phenol degradation-like protein  30.36 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2107  putative signal peptide protein  34.06 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2732  hypothetical protein  30.31 
 
 		 301 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.206778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08780  hypothetical protein  29.46 
 
 		 268 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6101  putative lipoprotein  28.44 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2127  phenol degradation-like protein  25.81 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2982  hypothetical protein  27.8 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000220614  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03076  putative signal peptide protein  32.02 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2845  phenol degradation-like protein  27.39 
 
 		 306 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70300  putative enzyme  28.17 
 
 		 316 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3168  hypothetical protein  28.17 
 
 		 315 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4527  hypothetical protein  28.12 
 
 		 310 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30840  hypothetical protein  28.38 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.856206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0883  hypothetical protein  25.08 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00462477  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32260  signal peptide protein  25.73 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1838  phenol metabolism protein  29.37 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1588  hypothetical protein  27.5 
 
 		 320 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4267  hypothetical protein  25.57 
 
 		 297 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3195  hypothetical protein  26.73 
 
 		 313 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0190  hypothetical protein  27.35 
 
 		 307 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3482  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.55 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3157  meta-pathway phenol degradation-like protein  27 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4488  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  30.29 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5460  hypothetical protein  25.8 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6407  hypothetical protein  27.59 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.579544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3274  hypothetical protein  27.16 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4501  MetA-pathway phenol degradation-like protein  26.87 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4890  hypothetical protein  27.16 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6119  hypothetical protein  28.02 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6917  hypothetical protein  26.72 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2098  hypothetical protein  26.01 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.591796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1833  putative signal peptide protein  24.06 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.714906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1728  hypothetical protein  25 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000180313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1956  hypothetical protein  30.77 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235366  hitchhiker  0.00028826 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7148  protein involved in meta-pathway of phenol degradation  30.54 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00536985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0368  hypothetical protein  24.77 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0355  hypothetical protein  24.05 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0295  hypothetical protein  27.47 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000520717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1158  putative signal peptide  29.17 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1931  hypothetical protein  22.9 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0341  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.225999  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3839  regulation of phenolics degradation protein  23.39 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4520  putative signal peptide  24.01 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5144  hypothetical protein  23.49 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2725  meta-pathway phenol degradation-like protein  26.67 
 
 		 288 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5224  hypothetical protein  26.13 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.347235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0005  hypothetical protein  23.26 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.489422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0164  hypothetical protein  21.54 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433262  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4832  hypothetical protein  22.12 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.922561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0598  hypothetical protein  28.05 
 
 		 364 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4536  phenol degradation protein  25 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375555  normal  0.225823 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5600  hypothetical protein  25 
 
 		 383 aa  43.1  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00091534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1148  meta-pathway phenol degradation-like protein  25.21 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0207  hypothetical protein  24.53 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.311208 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>